26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0674 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0674  Like-Sm ribonucleoprotein core  100 
 
 		 61 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.973126  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2097  Like-Sm ribonucleoprotein core  74.58 
 
 		 60 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.765143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  50 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  58.33 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2046  Like-Sm ribonucleoprotein core  47.44 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600722  normal  0.0639389 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  44.93 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  40 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  44.29 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.43 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  42.86 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  38.57 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  41.43 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  40 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  38.1 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  41.79 
 
 		 75 aa  49.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.43 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  44.26 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  38.57 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  37.31 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1521  like-Sm ribonucleoprotein core  34.33 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0711074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0398  like-Sm ribonucleoprotein core  34.33 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0437  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.33 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  37.88 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  32.84 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  38.46 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  36.54 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>