More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0699 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0699  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
305 aa  622  1e-177  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0708  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.86 
 
 
210 aa  110  3e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0295  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.52 
 
 
217 aa  107  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.831759  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0411  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.48 
 
 
207 aa  100  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1413  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.52 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_004310  BR0094  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.39 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0092  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.39 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1855  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.97 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.125429  normal  0.876599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0045  heme exporter protein CcmA  34.11 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.28 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02128  heme exporter subunit  31.78 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.854384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1458  heme exporter protein CcmA  31.78 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02087  hypothetical protein  31.78 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.809709  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2500  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.78 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2339  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.78 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1449  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.78 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0447  cytochrome c biogenesis protein CcmA  29.6 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0740  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.78 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3338  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.78 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1801  cytochrome c biogenesis protein CcmA  28.8 
 
 
210 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1404  heme exporter protein CcmA  34.92 
 
 
213 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2349  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.01 
 
 
205 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03135  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.06 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0954  heme exporter protein CcmA  35 
 
 
188 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1645  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.3 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2847  heme exporter protein CcmA  34.17 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0803665  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0459  cytochrome c biogenesis protein CcmA  29.13 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.573877  normal  0.123941 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2281  cytochrome c biogenesis protein CcmA  28.87 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0040  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.65 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1364  heme exporter protein CcmA  31.15 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2480  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.34 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1617  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.61 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0182148  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4030  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.34 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3739  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.99 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2059  heme exporter protein CcmA  26.92 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0106  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.62 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557498  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3508  heme exporter protein CcmA  33.88 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00280297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3391  cytochrome c biogenesis protein CcmA  28.79 
 
 
226 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002841  cytochrome c biogenesis ATPase component CcmA  29.55 
 
 
205 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4209  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.6 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4047  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.6 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.97 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.722912  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03074  ATP binding protein of heme exporter A  33.33 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2597  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.6 
 
 
207 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.984357  normal  0.326318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2438  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.6 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.065124  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3024  heme exporter protein CcmA  30.53 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4102  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.6 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2389  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.6 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2494  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.6 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4151  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.6 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4188  cytochrome c biogenesis protein CcmA  28.47 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0292  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.25 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0314378 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0205  cytochrome c biogenesis protein CcmA  29.41 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0526934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1421  heme exporter protein CcmA  27.01 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0524  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.09 
 
 
200 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4060  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.4 
 
 
211 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438117  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0999  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.09 
 
 
204 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15365  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0200  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.05 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0402446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3853  heme exporter protein CcmA  32.86 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113867  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1217  cytochrome c biogenesis protein CcmA  29.01 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1496  cytochrome c biogenesis protein CcmA  28.03 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1560  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.82 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0600798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1387  cytochrome c biogenesis protein CcmA  28.03 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0395  cytochrome c biogenesis protein CcmA  28.03 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.183524 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1518  heme exporter protein CcmA  31.01 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3415  heme exporter protein CcmA  31.5 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1284  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.06 
 
 
208 aa  67  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.339928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0409  cytochrome c biogenesis protein CcmA  29.13 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00865  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.09 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.09 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0966414  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0322  cytochrome c biogenesis protein CcmA  29.41 
 
 
200 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2759  heme exporter protein CcmA  24.88 
 
 
216 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1034  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.82 
 
 
219 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.359278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3991  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.94 
 
 
204 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4989  heme exporter protein CcmA  31.82 
 
 
204 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1866  ATP binding protein of heme exporter A  25.32 
 
 
223 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2699  cytochrome c biogenesis protein CcmA  27.34 
 
 
209 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2385  heme exporter protein CcmA  34.04 
 
 
207 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00141503  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3256  heme exporter protein CcmA  29.71 
 
 
178 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2728  cytochrome c biogenesis protein CcmA  29.71 
 
 
206 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5768  heme exporter protein CcmA  32.43 
 
 
212 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2424  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.71 
 
 
210 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  33.86 
 
 
309 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  35.71 
 
 
582 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1960  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.25 
 
 
212 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0948  Heme exporter protein CcmA  34.81 
 
 
216 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.589324  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1822  heme exporter protein CcmA  24.26 
 
 
194 aa  63.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99348  normal  0.178164 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2635  heme exporter protein CcmA  24.26 
 
 
215 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1215  heme ABC export system, ATP-binding protein CcmA  33.33 
 
 
220 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  19.59 
 
 
311 aa  63.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4766  cytochrome c biogenesis protein CcmA  29.66 
 
 
226 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1544  heme exporter protein CcmA  32.48 
 
 
234 aa  62.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123842 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3084  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.54 
 
 
207 aa  62.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4762  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.87 
 
 
309 aa  62.4  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000635501  hitchhiker  0.0000711162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2860  heme exporter protein CcmA  30.91 
 
 
215 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1383  heme exporter protein CcmA  29.46 
 
 
201 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3358  cytochrome c biogenesis protein CcmA  29.2 
 
 
202 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.502748  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0179  cytochrome c biogenesis protein CcmA  29.93 
 
 
216 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  27.78 
 
 
215 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0537  ABC transporter related  35.09 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>