249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0497 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 264 aa  517  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.455144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2708  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.59 
 
 		 280 aa  302  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.675497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2181  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64.14 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1809  condensin subunit ScpA  60.32 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1161  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.89 
 
 		 272 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700335  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.09 
 
 		 285 aa  274  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1485  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.61 
 
 		 285 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.991573  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2792  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.7 
 
 		 277 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0379741  normal  0.0326469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2671  hypothetical protein  57.49 
 
 		 273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2511  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.33 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.92 
 
 		 276 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.426419 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0871  segregation and condensation protein A  55.34 
 
 		 268 aa  267  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4410  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.92 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3191  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.18 
 
 		 277 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.762479  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1804  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.58 
 
 		 278 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.259114  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4419  condensin subunit ScpA  54.33 
 
 		 279 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2347  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.87 
 
 		 283 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169117  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0880  segregation and condensation protein A  57.33 
 
 		 245 aa  258  9e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1761  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.33 
 
 		 279 aa  249  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2483  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.64 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1775  condensin subunit ScpA  47.67 
 
 		 270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.208606  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1911  condensin subunit ScpA  48.99 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1867  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.46 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00662232  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1725  putative Segregation and condensation protein A  50.83 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.608158  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0905  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.63 
 
 		 263 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0323401  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2940  condensin subunit ScpA  50.21 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1585  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.21 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230404  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0953  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.6 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3025  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.58 
 
 		 352 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.747367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3932  condensin subunit ScpA  49.21 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0906  condensin subunit ScpA  46.25 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3121  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.63 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183261  normal  0.211142 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1510  condensin subunit ScpA  47.76 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1141  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.88 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1092  condensin subunit ScpA  48.75 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.15 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.649512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.18 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.17 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  39 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.26 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.26 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.89 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  37.55 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  36.33 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  36.33 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  37.6 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  36.73 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.73 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  36.07 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.54 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.87 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  35.25 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  33.73 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.97 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.8 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  38.78 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  36.51 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.39 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.77 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.97 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  35.25 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.19 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.39 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.19 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.96 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.25 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.13 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  37.34 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.86 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.36 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.12 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  37.19 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.08 
 
 		 285 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.27 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  36.36 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.38 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  36.36 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.98 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  37.96 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.1 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.82 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  35.1 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.1 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.39 
 
 		 262 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.1 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.8 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  36.8 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  35.68 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  37.3 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  34.01 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  36.55 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  33.75 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  33.87 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  33.61 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.16 
 
 		 291 aa  99.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.55 
 
 		 303 aa  99.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  33.87 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  34.68 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.21 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.97 
 
 		 290 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>