248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4419 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4419  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 279 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1804  chromosome segregation and condensation protein ScpA  78.21 
 
 		 278 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.259114  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2511  chromosome segregation and condensation protein ScpA  80.22 
 
 		 278 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2792  chromosome segregation and condensation protein ScpA  80.83 
 
 		 277 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0379741  normal  0.0326469 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1761  chromosome segregation and condensation protein ScpA  76.98 
 
 		 279 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3191  chromosome segregation and condensation protein ScpA  76.79 
 
 		 277 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.762479  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  76.26 
 
 		 276 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.426419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4410  chromosome segregation and condensation protein ScpA  62.26 
 
 		 282 aa  298  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2671  hypothetical protein  56.82 
 
 		 273 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1485  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.04 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.991573  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1161  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.38 
 
 		 272 aa  288  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700335  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1809  condensin subunit ScpA  60.08 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.77 
 
 		 285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2181  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.52 
 
 		 260 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2347  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.89 
 
 		 283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0871  segregation and condensation protein A  58.68 
 
 		 268 aa  268  8e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0880  segregation and condensation protein A  58.55 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2483  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.48 
 
 		 258 aa  241  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2940  condensin subunit ScpA  51.84 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1585  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.84 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230404  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2708  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.62 
 
 		 280 aa  235  7e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.675497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0905  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.43 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0323401  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.33 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.455144 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1725  putative Segregation and condensation protein A  50.61 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.608158  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0906  condensin subunit ScpA  48.41 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1867  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.03 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00662232  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1510  condensin subunit ScpA  49.6 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1911  condensin subunit ScpA  52.67 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3025  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.17 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.747367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3932  condensin subunit ScpA  51.63 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1141  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.09 
 
 		 270 aa  198  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1775  condensin subunit ScpA  47.08 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.208606  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3121  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.62 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183261  normal  0.211142 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0953  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.62 
 
 		 264 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1092  condensin subunit ScpA  49.8 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.15 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.649512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  38.64 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.14 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  38.11 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.58 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  39.09 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.95 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.1 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.34 
 
 		 262 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.07 
 
 		 266 aa  116  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.19 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  36.1 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.36 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.68 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.55 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.19 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.55 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.4 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  38.52 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  36.8 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.44 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.76 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.93 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.93 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.63 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  35.83 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  35 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.04 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.04 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.04 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  36.93 
 
 		 301 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  37.86 
 
 		 283 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.54 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  34.92 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.92 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  35.54 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  35.95 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  35.95 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.86 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  35.95 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  34.4 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.86 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  35.95 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  35.95 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  35.95 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  35.95 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.78 
 
 		 278 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.1 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.69 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  36.9 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  35.54 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.54 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.54 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.54 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.27 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.34 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.54 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.27 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  34.27 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  35.12 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  33.82 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  33.09 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  36.33 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  36.21 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  34.16 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>