242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1161 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1161  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 272 aa  539  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700335  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1485  chromosome segregation and condensation protein ScpA  75.49 
 
 		 285 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.991573  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  74.71 
 
 		 285 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2671  hypothetical protein  75.39 
 
 		 273 aa  381  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1809  condensin subunit ScpA  66.92 
 
 		 266 aa  361  6e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2347  chromosome segregation and condensation protein ScpA  67.98 
 
 		 283 aa  332  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0871  segregation and condensation protein A  66.4 
 
 		 268 aa  331  9e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0880  segregation and condensation protein A  67.97 
 
 		 245 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2792  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.76 
 
 		 277 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0379741  normal  0.0326469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4419  condensin subunit ScpA  57.38 
 
 		 279 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3191  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.69 
 
 		 277 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.762479  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1804  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.14 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.259114  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.25 
 
 		 276 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.426419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2511  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.2 
 
 		 278 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1761  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.96 
 
 		 279 aa  271  7e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4410  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.83 
 
 		 282 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2181  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.93 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.89 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.455144 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0905  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.16 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0323401  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2940  condensin subunit ScpA  52.74 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1585  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.74 
 
 		 264 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230404  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1867  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.32 
 
 		 284 aa  241  7.999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00662232  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1775  condensin subunit ScpA  50.62 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.208606  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2708  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.01 
 
 		 280 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.675497 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1725  putative Segregation and condensation protein A  50.81 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.608158  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1510  condensin subunit ScpA  51.79 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2483  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.88 
 
 		 258 aa  228  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0906  condensin subunit ScpA  49.18 
 
 		 265 aa  224  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3025  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.03 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.747367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3932  condensin subunit ScpA  51.49 
 
 		 257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3121  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.19 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183261  normal  0.211142 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0953  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.88 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1911  condensin subunit ScpA  46.89 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1141  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.61 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1092  condensin subunit ScpA  45.6 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.15 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.649512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  35.98 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.74 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.92 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.41 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.82 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.51 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  36.59 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.19 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.48 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.98 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.77 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.17 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.37 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.82 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  33.89 
 
 		 272 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  33.89 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  34.93 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.98 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.42 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.42 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  33.06 
 
 		 286 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.06 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  34.96 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  34.69 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  35.1 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.97 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 		 290 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 		 290 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.47 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.36 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  31.84 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.88 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  34.58 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.47 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.47 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  34.31 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  35.34 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  32.91 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  33.47 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  33.47 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.76 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.98 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  31.54 
 
 		 320 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  33.47 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.91 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.2 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  33.47 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  33.47 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  33.47 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  33.47 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.1 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  34.94 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  31.09 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.93 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  33.47 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  31.09 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  35.27 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  33.06 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.06 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  33.74 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  32.91 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  32.38 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>