251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4410 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4410  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 282 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2792  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.29 
 
 		 277 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0379741  normal  0.0326469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.52 
 
 		 276 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.426419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4419  condensin subunit ScpA  62.26 
 
 		 279 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3191  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.54 
 
 		 277 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.762479  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2511  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.09 
 
 		 278 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1804  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.48 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.259114  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1761  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.04 
 
 		 279 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2181  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64.88 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1485  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.79 
 
 		 285 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.991573  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2671  hypothetical protein  53.52 
 
 		 273 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1161  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.83 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700335  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.28 
 
 		 285 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1809  condensin subunit ScpA  57.87 
 
 		 266 aa  262  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0871  segregation and condensation protein A  58.44 
 
 		 268 aa  260  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2347  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.98 
 
 		 283 aa  254  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169117  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0880  segregation and condensation protein A  58.8 
 
 		 245 aa  252  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.92 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.455144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2483  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.14 
 
 		 258 aa  242  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2708  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.28 
 
 		 280 aa  235  8e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.675497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2940  condensin subunit ScpA  49.8 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1585  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.8 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230404  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0905  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.4 
 
 		 263 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0323401  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1775  condensin subunit ScpA  46.04 
 
 		 270 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.208606  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1867  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.21 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00662232  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0906  condensin subunit ScpA  48.16 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3025  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.14 
 
 		 352 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.747367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1725  putative Segregation and condensation protein A  45.66 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.608158  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1510  condensin subunit ScpA  47.29 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1911  condensin subunit ScpA  47.51 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3121  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.04 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183261  normal  0.211142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3932  condensin subunit ScpA  48.39 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0953  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.11 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1141  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.13 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1092  condensin subunit ScpA  48.29 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.04 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.649512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  36.03 
 
 		 276 aa  128  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  35.74 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.63 
 
 		 266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.48 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.02 
 
 		 262 aa  119  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.43 
 
 		 275 aa  118  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.54 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  34.16 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  34.68 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.67 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  34.98 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.36 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  36.36 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  35.63 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  33.33 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.69 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.14 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.3 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.1 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.6 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  34.14 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.92 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  36.03 
 
 		 304 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.83 
 
 		 262 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.6 
 
 		 284 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.96 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  34.55 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.98 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.02 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.06 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.64 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.27 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  33.74 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.54 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  35.22 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  34.38 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  32.54 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.38 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.42 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  37.14 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1400  hypothetical protein  32.64 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1596  hypothetical protein  32.64 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.38 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.38 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.38 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.38 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 281 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  34.66 
 
 		 283 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.98 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  34.77 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.2 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  30.86 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.86 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  33.59 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  33.59 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  33.87 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  33.59 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  33.59 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  33.59 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  33.59 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  33.59 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  32.92 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>