249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0441 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
301 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.649512  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0953  chromosome segregation and condensation protein ScpA  62.1 
 
 
264 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4410  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.92 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191831  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1775  condensin subunit ScpA  44.71 
 
 
270 aa  172  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.208606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4419  condensin subunit ScpA  46.99 
 
 
279 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2181  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.72 
 
 
260 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1809  condensin subunit ScpA  46.72 
 
 
266 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1485  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.13 
 
 
285 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.991573  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3932  condensin subunit ScpA  46.4 
 
 
257 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2511  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.15 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3121  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183261  normal  0.211142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.86 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441338  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0905  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.43 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0323401  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1585  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.56 
 
 
264 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230404  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2940  condensin subunit ScpA  46.96 
 
 
262 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2708  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.83 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.675497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3191  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.53 
 
 
277 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.762479  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1804  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.32 
 
 
278 aa  159  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.259114  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2671  hypothetical protein  43.75 
 
 
273 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1161  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.55 
 
 
272 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700335  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2347  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.32 
 
 
283 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169117  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1725  putative Segregation and condensation protein A  45.56 
 
 
264 aa  156  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.608158  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2792  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.92 
 
 
277 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0379741  normal  0.0326469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.08 
 
 
276 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.426419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1761  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.54 
 
 
279 aa  153  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0880  segregation and condensation protein A  44.72 
 
 
245 aa  152  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0871  segregation and condensation protein A  44.18 
 
 
268 aa  152  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0906  condensin subunit ScpA  44.31 
 
 
265 aa  152  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1867  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.53 
 
 
284 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00662232  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2483  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.21 
 
 
258 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1141  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.12 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1510  condensin subunit ScpA  44.8 
 
 
270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.509233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.35 
 
 
264 aa  145  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.455144 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1092  condensin subunit ScpA  46.85 
 
 
265 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1911  condensin subunit ScpA  39.53 
 
 
271 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3025  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.31 
 
 
352 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.747367  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.62 
 
 
281 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.38 
 
 
295 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  31.87 
 
 
266 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  33.1 
 
 
271 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.62 
 
 
284 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  31.87 
 
 
275 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.75 
 
 
275 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.69 
 
 
281 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  33.21 
 
 
276 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.58 
 
 
269 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  34.29 
 
 
272 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  34.29 
 
 
272 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  34.75 
 
 
272 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  33.46 
 
 
296 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  35.56 
 
 
296 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.84 
 
 
287 aa  99.4  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  32.06 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  33.1 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.58 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  34.85 
 
 
283 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  32.71 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.85 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  36.36 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.28 
 
 
285 aa  96.7  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.01 
 
 
287 aa  95.9  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  29.48 
 
 
248 aa  95.9  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  34.41 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.33 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.36 
 
 
276 aa  95.5  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.39 
 
 
290 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.14 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.39 
 
 
290 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  27.97 
 
 
247 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  27.69 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  27.69 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  27.69 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  32.86 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  32.86 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.11 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  32.86 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  32.86 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.68 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.1 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  27.69 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.54 
 
 
290 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  32.86 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.46 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  32.86 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  32.86 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  53.45 
 
 
274 aa  94  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  31.79 
 
 
290 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.79 
 
 
290 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.8 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.79 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.79 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  33.46 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 
283 aa  93.2  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  32.72 
 
 
304 aa  92.8  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  28.35 
 
 
247 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  28.35 
 
 
247 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  32.5 
 
 
291 aa  92.8  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  30.47 
 
 
291 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  27.73 
 
 
247 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  27.73 
 
 
247 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>