249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3025 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3025  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 352 aa  710    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.747367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1804  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.71 
 
 		 278 aa  242  7e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.259114  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1485  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.43 
 
 		 285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.991573  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1161  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.03 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700335  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2511  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.25 
 
 		 278 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.46 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1761  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.99 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2671  hypothetical protein  49.38 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1775  condensin subunit ScpA  49.61 
 
 		 270 aa  226  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.208606  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2940  condensin subunit ScpA  50.42 
 
 		 262 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1585  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.42 
 
 		 264 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230404  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2792  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.19 
 
 		 277 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0379741  normal  0.0326469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0905  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.83 
 
 		 263 aa  222  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0323401  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4419  condensin subunit ScpA  47.17 
 
 		 279 aa  222  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3191  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.61 
 
 		 277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.762479  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1809  condensin subunit ScpA  49.58 
 
 		 266 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4410  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.14 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.44 
 
 		 276 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.426419 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0871  segregation and condensation protein A  48.96 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2347  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.54 
 
 		 283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3121  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.24 
 
 		 274 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183261  normal  0.211142 
 
 
-
 
NC_004310  BR0880  segregation and condensation protein A  49.14 
 
 		 245 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1867  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.35 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00662232  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1911  condensin subunit ScpA  48.98 
 
 		 271 aa  209  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1510  condensin subunit ScpA  48.74 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1725  putative Segregation and condensation protein A  48.76 
 
 		 264 aa  206  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.608158  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2181  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.21 
 
 		 260 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1141  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.45 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0906  condensin subunit ScpA  47.92 
 
 		 265 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3932  condensin subunit ScpA  48.58 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.58 
 
 		 264 aa  192  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.455144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2708  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.74 
 
 		 280 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.675497 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0953  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.72 
 
 		 264 aa  179  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1092  condensin subunit ScpA  47.93 
 
 		 265 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2483  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.95 
 
 		 258 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.87 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.649512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.6 
 
 		 269 aa  97.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.12 
 
 		 262 aa  94  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  33.87 
 
 		 276 aa  94.4  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.64 
 
 		 262 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  30.38 
 
 		 304 aa  94  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.78 
 
 		 301 aa  93.6  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.92 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  27.56 
 
 		 262 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.64 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.85 
 
 		 302 aa  90.1  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  28.85 
 
 		 302 aa  90.1  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.67 
 
 		 262 aa  89.4  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.81 
 
 		 262 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.81 
 
 		 262 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.97 
 
 		 297 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.81 
 
 		 262 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.81 
 
 		 285 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.81 
 
 		 262 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.83 
 
 		 262 aa  88.6  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  31.23 
 
 		 286 aa  88.6  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  26.88 
 
 		 262 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  26.88 
 
 		 262 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  26.88 
 
 		 262 aa  87  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  30.74 
 
 		 283 aa  86.7  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.08 
 
 		 286 aa  86.3  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  29.55 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  33.06 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  32.26 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  29.89 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.08 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.46 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.38 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.59 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.74 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  30.28 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  33.47 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.25 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  28.97 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.53 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.74 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  29.64 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.37 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.25 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.27 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  42.2 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  37.16 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.34 
 
 		 278 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.15 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  45.74 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  30.31 
 
 		 262 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1954  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.53 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.67 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  45.24 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  27.49 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.36 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  29.73 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  28.4 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1751  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.68 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.133467  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.63 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.09 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  28.57 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  25.2 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  25.61 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1569  condensin subunit ScpA  41.53 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.729802  normal  0.82385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>