240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0906 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0906  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 265 aa  533  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2940  condensin subunit ScpA  72.58 
 
 		 262 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1585  chromosome segregation and condensation protein ScpA  72.58 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230404  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0905  chromosome segregation and condensation protein ScpA  71.37 
 
 		 263 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0323401  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1725  putative Segregation and condensation protein A  72 
 
 		 264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.608158  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1510  condensin subunit ScpA  72.06 
 
 		 270 aa  354  7.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509233 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1867  chromosome segregation and condensation protein ScpA  68.13 
 
 		 284 aa  335  5e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00662232  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1485  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.7 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.991573  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2671  hypothetical protein  52.52 
 
 		 273 aa  245  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.03 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1161  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.18 
 
 		 272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700335  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3191  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.96 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.762479  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1775  condensin subunit ScpA  47.24 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.208606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1809  condensin subunit ScpA  52.97 
 
 		 266 aa  231  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4419  condensin subunit ScpA  48.41 
 
 		 279 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1804  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.65 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.259114  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2511  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.95 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2792  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.83 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0379741  normal  0.0326469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.55 
 
 		 276 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.426419 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2347  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.74 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0871  segregation and condensation protein A  52.74 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3932  condensin subunit ScpA  50.21 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4410  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.16 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1761  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.27 
 
 		 279 aa  215  7e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0880  segregation and condensation protein A  52.16 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2181  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.89 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3121  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.72 
 
 		 274 aa  195  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183261  normal  0.211142 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3025  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.56 
 
 		 352 aa  195  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.747367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1141  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.38 
 
 		 270 aa  192  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1092  condensin subunit ScpA  50.21 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1911  condensin subunit ScpA  43.72 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0953  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.18 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2483  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.77 
 
 		 258 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2708  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.08 
 
 		 280 aa  184  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.675497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.25 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.455144 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.37 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.649512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.48 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.08 
 
 		 284 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.08 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  34.96 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  34.96 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  34.4 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.82 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.03 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  34.82 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.68 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  33.74 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  35 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.04 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.88 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 		 262 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.75 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.3 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.73 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  35.95 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.61 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  34.02 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  35.77 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.73 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.02 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.61 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  33.89 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.2 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.12 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  34.02 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  32.26 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.54 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.27 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  34.96 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  34.44 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.47 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  34.84 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.43 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  34.02 
 
 		 262 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  33.61 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.22 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  33.47 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  31.85 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  32.78 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.43 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.43 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  32.64 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.43 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  32 
 
 		 302 aa  98.6  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32 
 
 		 302 aa  98.6  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  32.64 
 
 		 301 aa  98.6  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.17 
 
 		 262 aa  98.6  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.82 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  31.8 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.06 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  32.27 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  31.17 
 
 		 293 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  34.41 
 
 		 279 aa  96.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.83 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.4 
 
 		 293 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  33.75 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  33.75 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  33.75 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  33.75 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  33.75 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>