235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2671 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2671  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  82.03 
 
 		 285 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1485  chromosome segregation and condensation protein ScpA  82.81 
 
 		 285 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.991573  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1161  chromosome segregation and condensation protein ScpA  75.39 
 
 		 272 aa  381  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700335  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1809  condensin subunit ScpA  68.73 
 
 		 266 aa  348  6e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2347  chromosome segregation and condensation protein ScpA  67.72 
 
 		 283 aa  325  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0871  segregation and condensation protein A  66.54 
 
 		 268 aa  324  8.000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0880  segregation and condensation protein A  68.94 
 
 		 245 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2511  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.34 
 
 		 278 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3191  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.47 
 
 		 277 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.762479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4419  condensin subunit ScpA  56.82 
 
 		 279 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.02 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.426419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2792  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.43 
 
 		 277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0379741  normal  0.0326469 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1804  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.75 
 
 		 278 aa  286  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.259114  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2181  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.96 
 
 		 260 aa  275  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1761  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.82 
 
 		 279 aa  271  8.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4410  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.52 
 
 		 282 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2483  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.14 
 
 		 258 aa  255  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2708  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.1 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.675497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.49 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.455144 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0905  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.28 
 
 		 263 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0323401  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2940  condensin subunit ScpA  51.45 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1585  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.45 
 
 		 264 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230404  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1867  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.68 
 
 		 284 aa  238  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00662232  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1775  condensin subunit ScpA  52.23 
 
 		 270 aa  238  9e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.208606  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0906  condensin subunit ScpA  52.52 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1725  putative Segregation and condensation protein A  52.74 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.608158  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1510  condensin subunit ScpA  52.32 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3025  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.38 
 
 		 352 aa  215  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.747367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3121  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.01 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183261  normal  0.211142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3932  condensin subunit ScpA  49.79 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1911  condensin subunit ScpA  46.84 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1141  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.2 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0953  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.64 
 
 		 264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1092  condensin subunit ScpA  45.06 
 
 		 265 aa  178  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.75 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.649512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.78 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.44 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.22 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.66 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.31 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.07 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.61 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  34.63 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 		 262 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.27 
 
 		 262 aa  112  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.95 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.95 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  35.12 
 
 		 262 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.54 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  35.66 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.98 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.54 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.54 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.9 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  34.71 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.79 
 
 		 285 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.73 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  33.47 
 
 		 262 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  35.12 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  35.12 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  35.12 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  35.12 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  33.47 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  34.82 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.12 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  35.12 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.82 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  35.12 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  35.12 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.33 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  35.12 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.33 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  34.57 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.87 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  32.91 
 
 		 286 aa  106  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.12 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.91 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.65 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.64 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.75 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.58 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  35.92 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.78 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  34.16 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  33.61 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  32.35 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  32.11 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.17 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  34 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  31.84 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.29 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.15 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  34.48 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.73 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.17 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  32.08 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>