250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1141 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1141  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 270 aa  521  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3932  condensin subunit ScpA  65.2 
 
 		 257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1092  condensin subunit ScpA  63.6 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0905  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.41 
 
 		 263 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0323401  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2940  condensin subunit ScpA  49.79 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1585  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.79 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230404  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2671  hypothetical protein  50.2 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1775  condensin subunit ScpA  49.22 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.208606  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2792  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.03 
 
 		 277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0379741  normal  0.0326469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4419  condensin subunit ScpA  53.53 
 
 		 279 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3025  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.59 
 
 		 352 aa  211  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.747367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3191  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.85 
 
 		 277 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.762479  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.42 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1485  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.16 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.991573  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1161  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700335  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1809  condensin subunit ScpA  50.83 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2511  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.41 
 
 		 278 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.426419 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1867  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.63 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00662232  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1804  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.62 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.259114  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1725  putative Segregation and condensation protein A  48.74 
 
 		 264 aa  201  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.608158  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1510  condensin subunit ScpA  50.84 
 
 		 270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1761  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.03 
 
 		 279 aa  199  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0906  condensin subunit ScpA  45.38 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2181  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.39 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0871  segregation and condensation protein A  51.05 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0880  segregation and condensation protein A  51.71 
 
 		 245 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2347  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50 
 
 		 283 aa  185  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169117  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.63 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.455144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4410  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.13 
 
 		 282 aa  178  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2708  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.24 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.675497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2483  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.95 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0953  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.69 
 
 		 264 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1911  condensin subunit ScpA  44.4 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3121  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.44 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183261  normal  0.211142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.12 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.649512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  35.71 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.63 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.83 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  32.82 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.44 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  32.83 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  32.08 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.36 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  34.65 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  34.65 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  34.23 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.98 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  34.98 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  32.82 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.71 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.2 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  34.98 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  34.98 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  34.98 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  34.98 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  34.98 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  34.98 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  34.98 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  33.83 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  32.41 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.9 
 
 		 281 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  34.63 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.81 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.95 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.71 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.71 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.08 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.58 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  32.21 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  34.24 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.2 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.58 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  34.72 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.2 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.85 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  29.96 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.85 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  33.58 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  34.24 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  33.08 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.23 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  34.24 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.21 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.03 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  34.73 
 
 		 266 aa  99.4  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.85 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.44 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.85 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  32.2 
 
 		 283 aa  99.4  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.47 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.47 
 
 		 290 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  33.08 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.59 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  31.09 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  30.54 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.46 
 
 		 276 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  27.41 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  27.41 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>