250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1092 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1092  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 265 aa  520  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3932  condensin subunit ScpA  68.07 
 
 		 257 aa  297  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1141  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.94 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1867  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.08 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00662232  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2940  condensin subunit ScpA  51.05 
 
 		 262 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1510  condensin subunit ScpA  53.73 
 
 		 270 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509233 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1585  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.05 
 
 		 264 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230404  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0905  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.05 
 
 		 263 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0323401  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1725  putative Segregation and condensation protein A  52.3 
 
 		 264 aa  214  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.608158  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1775  condensin subunit ScpA  49.17 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.208606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1161  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.6 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700335  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.83 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2671  hypothetical protein  44.88 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0906  condensin subunit ScpA  50.21 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1485  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.63 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.991573  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1809  condensin subunit ScpA  44.44 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0871  segregation and condensation protein A  47.64 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2511  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.13 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4419  condensin subunit ScpA  49.8 
 
 		 279 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2347  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.9 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2792  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.55 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0379741  normal  0.0326469 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1804  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.37 
 
 		 278 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.259114  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2181  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.42 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3191  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.13 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.762479  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.13 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.426419 
 
 
-
 
NC_004310  BR0880  segregation and condensation protein A  50 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3025  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.93 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.747367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1761  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.35 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4410  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.29 
 
 		 282 aa  188  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1911  condensin subunit ScpA  43.68 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0953  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.55 
 
 		 264 aa  185  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2708  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.11 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.675497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.44 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.455144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2483  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.6 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3121  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.29 
 
 		 274 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183261  normal  0.211142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.37 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.649512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  35.71 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.68 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  34.98 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  34.57 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.42 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  34.16 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.87 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.3 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.08 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.57 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  36.13 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.57 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  35.62 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  34.16 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.25 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1400  hypothetical protein  34.03 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1596  hypothetical protein  34.03 
 
 		 263 aa  99  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.28 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.44 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.5 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.44 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  33.76 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  32.34 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  32.91 
 
 		 283 aa  95.9  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.57 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  32.92 
 
 		 302 aa  95.5  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.92 
 
 		 302 aa  95.5  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.47 
 
 		 262 aa  95.1  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  33.47 
 
 		 279 aa  95.5  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.95 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.51 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.87 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.87 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.87 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  32.23 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.87 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  31.82 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.16 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.64 
 
 		 262 aa  93.2  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  32.91 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  32.23 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  32.23 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.63 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.03 
 
 		 276 aa  92  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  31.51 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  34.31 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  34.57 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  32.77 
 
 		 293 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.2 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  33.89 
 
 		 284 aa  89.7  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  32.92 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  29.15 
 
 		 248 aa  89.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.65 
 
 		 283 aa  89  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  33.33 
 
 		 283 aa  88.6  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  34.57 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.43 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.92 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  31.91 
 
 		 275 aa  86.7  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.22 
 
 		 290 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.22 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.77 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.22 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>