More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2852 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2852  putative oxidoreductase protein  100 
 
 
264 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.91402  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73 
 
 
263 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.44 
 
 
278 aa  353  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.68 
 
 
262 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3138  oxidoreductase protein  66.54 
 
 
262 aa  344  8e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.22 
 
 
262 aa  334  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.33 
 
 
279 aa  332  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1425  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  59.54 
 
 
264 aa  331  7.000000000000001e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200341  normal  0.111213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.98 
 
 
265 aa  322  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4076  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.61 
 
 
264 aa  321  9.000000000000001e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142044  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.16 
 
 
264 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.126254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.54 
 
 
264 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0734919  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.02 
 
 
265 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.54 
 
 
264 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0737567  normal  0.413876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.77 
 
 
263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.35539  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.4 
 
 
264 aa  305  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0585429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5043  putative short-chain dehydrogenase  58.46 
 
 
264 aa  304  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.239817  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3784  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.16 
 
 
264 aa  304  8.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0333055  hitchhiker  0.00262398 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.31 
 
 
263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.834586 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.69 
 
 
264 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.94 
 
 
263 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0549693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.56 
 
 
263 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.85 
 
 
262 aa  300  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.11 
 
 
263 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.73 
 
 
264 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.53126  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.51 
 
 
265 aa  299  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.434942 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1694  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.85 
 
 
341 aa  297  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.636471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.25 
 
 
264 aa  296  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46890  putative short-chain dehydrogenase  58.4 
 
 
264 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000947706 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.32 
 
 
264 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83567  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1069  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  57.31 
 
 
264 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304353  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.15 
 
 
264 aa  292  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.36792  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0986  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  56.92 
 
 
264 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1399  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  56.92 
 
 
264 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1482  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  56.92 
 
 
264 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0516  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  56.92 
 
 
264 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0132  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  56.92 
 
 
264 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383327  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2852  putative short-chain dehydrogenase/reductase  55.56 
 
 
264 aa  289  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2301  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  56.49 
 
 
264 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4504  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.08 
 
 
264 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 
264 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.070024  normal  0.514561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1733  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.92 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.62 
 
 
263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622858  normal  0.939609 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.44 
 
 
264 aa  282  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.73 
 
 
264 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.11 
 
 
264 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 
264 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.643515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 
264 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.665847 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 
264 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.804002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.87 
 
 
263 aa  279  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.42 
 
 
263 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188706  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4040  putative short-chain dehydrogenase  57.63 
 
 
264 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
264 aa  276  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.23 
 
 
264 aa  275  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000274382 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.67 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.31 
 
 
264 aa  270  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.29 
 
 
264 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6757  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.83 
 
 
264 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.24 
 
 
264 aa  265  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3522  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.91 
 
 
265 aa  263  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.23 
 
 
263 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144815  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.41 
 
 
264 aa  255  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.221391  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.53 
 
 
263 aa  251  6e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192712  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2029  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.15 
 
 
265 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14190  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  50.76 
 
 
264 aa  248  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.785349  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.88 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3169  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.71 
 
 
264 aa  242  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000352781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3407  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  47.71 
 
 
264 aa  242  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3188  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.71 
 
 
264 aa  241  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3440  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.71 
 
 
264 aa  241  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.38 
 
 
264 aa  240  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719452  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.71 
 
 
259 aa  239  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.214725  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3420  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  47.33 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3090  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.33 
 
 
264 aa  238  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.24 
 
 
260 aa  234  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00860975  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12520  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  51.15 
 
 
263 aa  231  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
262 aa  228  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000526189  normal  0.715416 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 
264 aa  225  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000288198  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5113  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.25 
 
 
187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.05 
 
 
263 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0501605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 
265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.542454 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
266 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
263 aa  155  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.148481  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.88 
 
 
268 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
266 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
266 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.471953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.22 
 
 
258 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1271  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.91 
 
 
258 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0546  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.15 
 
 
258 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4708  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 
279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.45 
 
 
277 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4364  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.05 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.95 
 
 
256 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1981  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.38 
 
 
259 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.38 
 
 
259 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.0473698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
267 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190565  normal  0.0181736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1586  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.62 
 
 
261 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0571917  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1665  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.05 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>