More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4504 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4504  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
264 aa  531  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4076  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.14 
 
 
264 aa  401  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142044  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.96 
 
 
263 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.834586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2852  putative short-chain dehydrogenase/reductase  67.42 
 
 
264 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46890  putative short-chain dehydrogenase  67.8 
 
 
264 aa  362  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000947706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.15 
 
 
264 aa  358  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.36792  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.02 
 
 
263 aa  357  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622858  normal  0.939609 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.42 
 
 
264 aa  353  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000274382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.16 
 
 
263 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144815  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.64 
 
 
264 aa  343  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.15 
 
 
264 aa  342  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.070024  normal  0.514561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4040  putative short-chain dehydrogenase  67.42 
 
 
264 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5043  putative short-chain dehydrogenase  65.15 
 
 
264 aa  338  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.239817  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.02 
 
 
264 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.22 
 
 
264 aa  335  5e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.64 
 
 
264 aa  333  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1733  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.64 
 
 
264 aa  331  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.36 
 
 
264 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0737567  normal  0.413876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.36 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.126254 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1694  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  62.12 
 
 
341 aa  325  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.636471  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.36 
 
 
264 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.643515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.36 
 
 
264 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.665847 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1069  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.98 
 
 
264 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304353  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.36 
 
 
264 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.804002 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0516  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.61 
 
 
264 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0132  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.61 
 
 
264 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383327  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1399  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.61 
 
 
264 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1482  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.61 
 
 
264 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0986  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.98 
 
 
264 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2301  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.61 
 
 
264 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.85 
 
 
264 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0734919  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.49 
 
 
265 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3522  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.56 
 
 
265 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.85 
 
 
264 aa  309  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.53126  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.54 
 
 
264 aa  308  6.999999999999999e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0585429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.56 
 
 
263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.17 
 
 
263 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0549693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.47 
 
 
265 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.33 
 
 
263 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299439 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.98 
 
 
264 aa  299  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2029  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.61 
 
 
265 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.31 
 
 
262 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.71 
 
 
265 aa  294  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.434942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2852  putative oxidoreductase protein  58.08 
 
 
264 aa  292  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.91402  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.78 
 
 
278 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.2 
 
 
264 aa  289  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6757  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.25 
 
 
264 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.78 
 
 
262 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.27 
 
 
264 aa  288  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.34 
 
 
263 aa  279  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3138  oxidoreductase protein  58.33 
 
 
262 aa  279  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.79 
 
 
264 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83567  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1425  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.33 
 
 
264 aa  276  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200341  normal  0.111213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.06 
 
 
279 aa  276  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3784  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.82 
 
 
264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0333055  hitchhiker  0.00262398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.23 
 
 
263 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188706  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.61 
 
 
264 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.221391  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14190  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  53.23 
 
 
264 aa  262  4.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.785349  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.85 
 
 
264 aa  261  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719452  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.91 
 
 
262 aa  254  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 
263 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3407  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  47.15 
 
 
264 aa  245  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3188  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.77 
 
 
264 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3440  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.77 
 
 
264 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.06 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.35539  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3420  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  46.77 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
264 aa  242  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3090  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.77 
 
 
264 aa  242  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3169  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.39 
 
 
264 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000352781  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.47 
 
 
259 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.23 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.214725  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
262 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000526189  normal  0.715416 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.25 
 
 
264 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.25 
 
 
264 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12520  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  49.23 
 
 
263 aa  225  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.11 
 
 
263 aa  225  7e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.01 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00860975  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
264 aa  219  5e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000288198  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5113  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.72 
 
 
187 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.38 
 
 
268 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
268 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
263 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0501605 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.7 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.471953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
266 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
268 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
268 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
263 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31260  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  33.21 
 
 
266 aa  142  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.974628  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
263 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.148481  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.542454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
263 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1821  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 
264 aa  132  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
265 aa  132  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.60133 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1057  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.1 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660829  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1210  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.18 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.475284  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
261 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524873  normal  0.240055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>