279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8148 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_8148  Carboxylyase-related protein  100 
 
 
565 aa  1174    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.733073  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2535  carboxylyase-like protein  31.34 
 
 
527 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2353  carboxylyase-like protein  31.8 
 
 
531 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.630162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  27.71 
 
 
493 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2102  carboxylyase-like protein  28.31 
 
 
514 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  29.91 
 
 
491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.73 
 
 
506 aa  147  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4699  UbiD family decarboxylase  27.7 
 
 
443 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.95 
 
 
522 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4939  UbiD family decarboxylase  27.03 
 
 
443 aa  144  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258846  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2042  UbiD family decarboxylase  27.21 
 
 
502 aa  143  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527905  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3999  UbiD family decarboxylase  29.32 
 
 
457 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428522  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0006  UbiD family decarboxylase  27.21 
 
 
502 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  29.55 
 
 
488 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  27.17 
 
 
479 aa  140  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  29.55 
 
 
488 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3716  UbiD family decarboxylase  29.12 
 
 
469 aa  139  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3609  UbiD family decarboxylase  27.44 
 
 
464 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3632  UbiD family decarboxylase  26.14 
 
 
502 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2481  UbiD family decarboxylase  26.14 
 
 
502 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.28 
 
 
506 aa  137  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  27.23 
 
 
481 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  26.26 
 
 
482 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.53 
 
 
488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7140  UbiD family decarboxylase  27.62 
 
 
464 aa  135  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493954  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  26.55 
 
 
504 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  26.33 
 
 
502 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3430  carboxylyase-like protein  27.25 
 
 
461 aa  134  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540081  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0356  UbiD family decarboxylase  27.97 
 
 
606 aa  134  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.99218 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  27.91 
 
 
480 aa  133  6.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  28.2 
 
 
492 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1121  carboxylyase-like protein  27.34 
 
 
462 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  26.99 
 
 
617 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  26.82 
 
 
521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_002978  WD1315  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  34.06 
 
 
492 aa  131  3e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0561345  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4166  Carboxylyase-related protein  27.1 
 
 
498 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  26.65 
 
 
487 aa  131  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  28.19 
 
 
487 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10361  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.57 
 
 
509 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.14 
 
 
498 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.81 
 
 
506 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.09 
 
 
495 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.81 
 
 
498 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0730  UbiD family decarboxylase  28.84 
 
 
606 aa  130  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.71 
 
 
520 aa  130  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  30.87 
 
 
496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  28.25 
 
 
488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.97 
 
 
498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.77 
 
 
488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0381  carboxylyase-like protein  27.25 
 
 
476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1108  carboxylyase-like protein  27.41 
 
 
446 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1167  carboxylyase-like protein  27.69 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.879428  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0636  carboxylyase-like protein  26.94 
 
 
464 aa  128  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1473  carboxylyase-like protein  34.21 
 
 
425 aa  128  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0383556  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.94 
 
 
497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  27.46 
 
 
488 aa  127  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1132  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  26.53 
 
 
520 aa  127  6e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  27.47 
 
 
495 aa  127  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.66 
 
 
497 aa  127  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  30.66 
 
 
497 aa  127  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  30.66 
 
 
497 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.66 
 
 
497 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.66 
 
 
497 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.66 
 
 
497 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  28.34 
 
 
488 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.52 
 
 
488 aa  126  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  28.34 
 
 
550 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06711  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  26 
 
 
525 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1325  carboxylyase-like protein  26.11 
 
 
520 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.66 
 
 
497 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.39 
 
 
497 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  28.34 
 
 
488 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  27.55 
 
 
493 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  25.76 
 
 
525 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  27.1 
 
 
493 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  28.34 
 
 
488 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  30.71 
 
 
487 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  30.19 
 
 
498 aa  124  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.44 
 
 
501 aa  124  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.29 
 
 
517 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  26.53 
 
 
490 aa  124  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  29.21 
 
 
488 aa  124  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6115  UbiD family decarboxylase  26.95 
 
 
504 aa  124  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612596  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.25 
 
 
488 aa  124  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.66 
 
 
492 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.66 
 
 
492 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2251  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.69 
 
 
502 aa  124  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202201 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  29.53 
 
 
498 aa  123  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3212  UbiD family decarboxylase  25.64 
 
 
594 aa  123  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7527  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  25.63 
 
 
455 aa  123  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.66 
 
 
492 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.66 
 
 
492 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.66 
 
 
492 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3106  UbiD family decarboxylase  28.72 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540273  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0888  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.72 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  27.31 
 
 
493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  27.31 
 
 
493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  27.31 
 
 
493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  27.31 
 
 
493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  27.08 
 
 
485 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>