More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2871 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2871  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
352 aa  740    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.34 
 
 
357 aa  512  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.34 
 
 
357 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.62 
 
 
357 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.12 
 
 
355 aa  503  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3530  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.77 
 
 
358 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.67 
 
 
353 aa  499  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.74 
 
 
360 aa  480  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0627905  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.87 
 
 
354 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.261657  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.16 
 
 
354 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0259  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.54 
 
 
357 aa  441  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.12 
 
 
357 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0041  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.4 
 
 
357 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0865438  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.83 
 
 
358 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.707519  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3699  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.69 
 
 
353 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.682682  normal  0.543496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.35 
 
 
354 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1767  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.49 
 
 
369 aa  242  6e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216648  normal  0.868455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2951  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.43 
 
 
341 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.46 
 
 
339 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 
341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
369 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00197458  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
339 aa  147  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
367 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
354 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
351 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 
352 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 
342 aa  139  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 
352 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 
680 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.85 
 
 
352 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
353 aa  135  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 
342 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.43 
 
 
345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 
355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2428  CDP-paratose 2-epimerase  33.57 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  hitchhiker  0.000207654 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0777  dNTP-hexose dehydratase/epimerase  30.82 
 
 
338 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.955272  normal  0.0951081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3352  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.58 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.133016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.316579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000159776  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
672 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
672 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
669 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
368 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.329626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
367 aa  123  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0770236  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.568981  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 
685 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
339 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
684 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0250  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0680968 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
355 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  27.4 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  27.58 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  27.45 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  26.89 
 
 
326 aa  94  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1398  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  28.18 
 
 
365 aa  93.6  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
326 aa  93.2  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  28.11 
 
 
328 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
323 aa  93.2  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  26.38 
 
 
323 aa  92.8  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1379  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  27.81 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000705991 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
308 aa  92  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2890  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  26.94 
 
 
356 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4202  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.47 
 
 
355 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3030  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  28.19 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 
333 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 
322 aa  90.5  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.2 
 
 
354 aa  90.1  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.3 
 
 
367 aa  90.1  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
321 aa  90.1  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.57 
 
 
353 aa  89.7  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4133  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.2 
 
 
355 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4251  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.2 
 
 
355 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4310  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.2 
 
 
355 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.847685  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4148  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.2 
 
 
355 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3018  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  28.13 
 
 
371 aa  89.4  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  28.49 
 
 
359 aa  89.4  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0342732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
318 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.87 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  25.56 
 
 
321 aa  88.6  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  27.51 
 
 
323 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  27.81 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
312 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2663  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  27.3 
 
 
362 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0707  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.53 
 
 
339 aa  87.8  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0585358  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01947  dTDP-glucose 4,6 dehydratase, NAD(P)-binding  27.96 
 
 
361 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2900  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  27.08 
 
 
358 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2847  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
324 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
331 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01936  hypothetical protein  27.96 
 
 
361 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0243  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  27.02 
 
 
363 aa  87  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0180  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  27.02 
 
 
363 aa  87  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00991  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  28.74 
 
 
360 aa  87  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  26.8 
 
 
339 aa  87  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.670308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>