More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1267 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
354 aa  746    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.261657  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.68 
 
 
354 aa  597  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.03 
 
 
360 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0627905  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.41 
 
 
355 aa  494  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.87 
 
 
353 aa  495  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.29 
 
 
357 aa  488  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.02 
 
 
357 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.02 
 
 
357 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3530  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.29 
 
 
358 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2871  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.87 
 
 
352 aa  471  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0259  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.08 
 
 
357 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.37 
 
 
357 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0041  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.08 
 
 
357 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0865438  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.69 
 
 
358 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.707519  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3699  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.23 
 
 
353 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.682682  normal  0.543496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.49 
 
 
354 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1767  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 
369 aa  231  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216648  normal  0.868455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2951  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.85 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519478  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 
373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00197458  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 
369 aa  142  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 
352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
339 aa  139  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
352 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 
339 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 
341 aa  138  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
367 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
354 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
680 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
363 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.568981  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
368 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.329626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
364 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0770236  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
354 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 
669 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 
672 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
672 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0250  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
685 aa  112  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
684 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
345 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0777  dNTP-hexose dehydratase/epimerase  27.67 
 
 
338 aa  109  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.955272  normal  0.0951081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
353 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2428  CDP-paratose 2-epimerase  28.57 
 
 
338 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  hitchhiker  0.000207654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
339 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
355 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3352  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.58 
 
 
355 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.133016 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000159776  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
353 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.316579 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
355 aa  90.9  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0680968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
288 aa  89.7  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 
309 aa  87.8  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3395  UDP-glucose 4-epimerase  27.97 
 
 
338 aa  87  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 
309 aa  87  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.97 
 
 
342 aa  86.7  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00991  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  26.24 
 
 
360 aa  86.3  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4310  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.91 
 
 
355 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.847685  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4148  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.91 
 
 
355 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4133  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.91 
 
 
355 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4251  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.91 
 
 
355 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.11 
 
 
360 aa  85.9  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3030  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  26.35 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  26.76 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2456  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.35 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.7 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1511  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.67 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.37 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4202  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.51 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.92 
 
 
355 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.39 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.25 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.18 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  27.42 
 
 
339 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2131  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25 
 
 
358 aa  84  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.39 
 
 
322 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.1 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.58 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.94 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.92 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.74 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  26.03 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0307  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.93 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.1 
 
 
322 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.1 
 
 
322 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.57 
 
 
318 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3018  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  26.1 
 
 
371 aa  82  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.25 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.19 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2437  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  26.85 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000861453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.02 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.2 
 
 
351 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>