More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2077 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
363 aa  719    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.568981  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  89.04 
 
 
364 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0770236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.61 
 
 
368 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.329626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.31 
 
 
354 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.1 
 
 
367 aa  447  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.05 
 
 
363 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0250  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.76 
 
 
363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.01 
 
 
680 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.92 
 
 
367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.82 
 
 
373 aa  398  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00197458  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.69 
 
 
672 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.69 
 
 
672 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.43 
 
 
669 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.31 
 
 
685 aa  329  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.68 
 
 
684 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.22 
 
 
352 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.66 
 
 
354 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.92 
 
 
352 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.72 
 
 
352 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.06 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.67 
 
 
369 aa  277  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.66 
 
 
341 aa  248  8e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.57 
 
 
345 aa  248  8e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.35 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2428  CDP-paratose 2-epimerase  38.6 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  hitchhiker  0.000207654 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0777  dNTP-hexose dehydratase/epimerase  39.6 
 
 
338 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.955272  normal  0.0951081 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 
355 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.76 
 
 
339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.66 
 
 
342 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.14 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 
351 aa  173  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.34 
 
 
355 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.93 
 
 
306 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1767  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
369 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216648  normal  0.868455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
353 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.17 
 
 
310 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3699  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.67 
 
 
353 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.682682  normal  0.543496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.47 
 
 
310 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 
309 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.17 
 
 
310 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 
360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0627905  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.17 
 
 
310 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.261657  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
314 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.05 
 
 
309 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
325 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2871  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.89 
 
 
352 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 
358 aa  136  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.707519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.74 
 
 
309 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000159776  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 
357 aa  135  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.15 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3530  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.51 
 
 
317 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
373 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.26 
 
 
318 aa  133  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.75 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0436408  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0041  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.42 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0865438  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.53 
 
 
323 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 
357 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  33.92 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.83 
 
 
312 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
333 aa  129  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0698  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.39 
 
 
372 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.63 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.76 
 
 
306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 
312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.92 
 
 
342 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.83 
 
 
323 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
310 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.78 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.83 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.611799  normal  0.380858 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.35 
 
 
331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1749  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.33 
 
 
354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.25 
 
 
362 aa  126  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2596  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.81 
 
 
353 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.96 
 
 
364 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
328 aa  126  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
353 aa  126  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 
354 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.78 
 
 
322 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 
357 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.72 
 
 
336 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3969  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.95 
 
 
353 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00429727  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.86 
 
 
367 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.36 
 
 
322 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1469  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.21 
 
 
397 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.793194  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
357 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3105  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.95 
 
 
353 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311481  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0878  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.24 
 
 
353 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 
309 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.49 
 
 
322 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.57 
 
 
322 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.49 
 
 
322 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>