More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1767 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1767  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
369 aa  775    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216648  normal  0.868455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.13 
 
 
358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.707519  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3699  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.11 
 
 
353 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.682682  normal  0.543496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2871  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.49 
 
 
352 aa  242  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 
353 aa  239  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.64 
 
 
360 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0627905  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0259  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.52 
 
 
357 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.53 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
354 aa  233  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 
357 aa  232  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 
354 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.261657  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.43 
 
 
357 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3530  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 
358 aa  229  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.14 
 
 
357 aa  226  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 
355 aa  219  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0041  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.59 
 
 
357 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0865438  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.77 
 
 
357 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00197458  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 
367 aa  170  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 
341 aa  159  5e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 
339 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
345 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0777  dNTP-hexose dehydratase/epimerase  33.43 
 
 
338 aa  155  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.955272  normal  0.0951081 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 
672 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.69 
 
 
669 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
672 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 
352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.17 
 
 
368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.329626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2428  CDP-paratose 2-epimerase  33.33 
 
 
338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  hitchhiker  0.000207654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
367 aa  146  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
363 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0250  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
363 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
369 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 
351 aa  142  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
680 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
354 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0770236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
342 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
339 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
354 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
363 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.568981  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
684 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
685 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
355 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
355 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
333 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
313 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.6 
 
 
322 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.6 
 
 
322 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
306 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.3 
 
 
322 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
302 aa  100  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27 
 
 
322 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.43 
 
 
323 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.55 
 
 
323 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.41 
 
 
322 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.41 
 
 
322 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.41 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.64 
 
 
312 aa  99  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
330 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
308 aa  96.3  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  28.27 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1863  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.64 
 
 
348 aa  94.4  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1222  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  29.39 
 
 
348 aa  94.4  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
326 aa  94.4  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3352  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.02 
 
 
355 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.133016 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.56 
 
 
310 aa  93.2  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 
335 aa  93.2  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
299 aa  92.8  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
304 aa  92.8  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1421  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.6 
 
 
345 aa  92.4  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.829571  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1758  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.07 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2951  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.72 
 
 
341 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519478  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  26.21 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.42 
 
 
307 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0204  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.21 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
324 aa  90.1  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3352  CDP-glucose 4,6-dehydratase  26.25 
 
 
362 aa  89.7  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.26 
 
 
344 aa  89.4  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0707  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.87 
 
 
339 aa  89.4  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0585358  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
322 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33900  UDP-glucose 4-epimerase  29.85 
 
 
313 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.97 
 
 
350 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
332 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 
285 aa  88.2  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.11 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.58 
 
 
323 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.54 
 
 
342 aa  87.4  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0358  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.33 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.58 
 
 
323 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.39 
 
 
342 aa  87  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2679  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.6 
 
 
332 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0614199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>