More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6291 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  98.87 
 
 
357 aa  744    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  85.15 
 
 
357 aa  662    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
357 aa  755    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3530  NAD-dependent epimerase/dehydratase  81.69 
 
 
358 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2871  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.34 
 
 
352 aa  514  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.44 
 
 
360 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0627905  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.87 
 
 
354 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.16 
 
 
355 aa  480  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.02 
 
 
354 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.261657  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.07 
 
 
353 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0259  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.51 
 
 
357 aa  431  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.66 
 
 
357 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0041  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.41 
 
 
357 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0865438  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.81 
 
 
358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.707519  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3699  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.83 
 
 
353 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.682682  normal  0.543496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.84 
 
 
354 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2951  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 
341 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519478  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1767  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.43 
 
 
369 aa  229  5e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216648  normal  0.868455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.64 
 
 
354 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.75 
 
 
369 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 
339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 
341 aa  146  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
367 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.66 
 
 
351 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
339 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
355 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00197458  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
339 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 
354 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
352 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000159776  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
352 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 
345 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
352 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
352 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 
342 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0777  dNTP-hexose dehydratase/epimerase  30.21 
 
 
338 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.955272  normal  0.0951081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.75 
 
 
367 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
353 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.316579 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 
672 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
680 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3352  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.58 
 
 
355 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.133016 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 
672 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.61 
 
 
669 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.329626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0250  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
363 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
363 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.568981  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2428  CDP-paratose 2-epimerase  31.6 
 
 
338 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  hitchhiker  0.000207654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0680968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0770236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
684 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 
685 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0304  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.4 
 
 
345 aa  88.6  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.92366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
309 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.14 
 
 
317 aa  86.7  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  28.2 
 
 
359 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0342732 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1379  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  27.33 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000705991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
288 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3018  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  27.94 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4251  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.25 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4148  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.25 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  25.9 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4133  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.25 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.33 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4310  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.25 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.847685  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3030  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  27.33 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.63 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.41 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  26.91 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4202  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.97 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  25.21 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.64 
 
 
312 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.64 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0180  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  27.17 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0243  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  27.17 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  25.22 
 
 
354 aa  77  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 
326 aa  77  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1421  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.7 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.829571  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2890  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  26.32 
 
 
356 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1401  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  28.12 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0069994 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1616  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.59 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945868  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1749  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.6 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  27.56 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1472  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  25.73 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239272  normal  0.402949 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1234  UDP-glucose 4-epimerase  29.38 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0382166  normal  0.453706 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00991  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  25.65 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.28 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  27.33 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2132  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.76 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.67 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.99 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.48 
 
 
306 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.78 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>