More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0046 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
357 aa  748    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0041  NAD-dependent epimerase/dehydratase  96.36 
 
 
357 aa  724    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0865438  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0259  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.54 
 
 
357 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.15 
 
 
355 aa  477  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.17 
 
 
353 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.76 
 
 
354 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.97 
 
 
360 aa  424  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0627905  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.37 
 
 
354 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.261657  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2871  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.12 
 
 
352 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.26 
 
 
357 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.66 
 
 
357 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.7 
 
 
357 aa  408  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3530  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.87 
 
 
358 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3699  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.57 
 
 
353 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.682682  normal  0.543496 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.97 
 
 
358 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.707519  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.99 
 
 
354 aa  355  7.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1767  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.77 
 
 
369 aa  217  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216648  normal  0.868455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2951  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
341 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519478  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 
367 aa  152  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 
341 aa  139  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
368 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.329626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 
367 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 
351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 
680 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00197458  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 
672 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 
342 aa  125  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 
672 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
363 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
669 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.75 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0777  dNTP-hexose dehydratase/epimerase  28.89 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.955272  normal  0.0951081 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
352 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 
364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0770236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0250  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 
363 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
352 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2428  CDP-paratose 2-epimerase  30.04 
 
 
338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  hitchhiker  0.000207654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
355 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
354 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 
363 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.568981  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 
345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
342 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 
369 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
685 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
352 aa  99.8  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000159776  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
353 aa  99.4  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.316579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
684 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
355 aa  96.3  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0680968 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3352  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.36 
 
 
355 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.133016 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  26.91 
 
 
333 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
323 aa  90.1  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  28.41 
 
 
328 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  26.75 
 
 
323 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  28.69 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  27.73 
 
 
329 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0307  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.64 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  26.24 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1681  putative nucleotide sugar epimerase  24.62 
 
 
348 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.174267  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0304  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.86 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.92366  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  22.32 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.94 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  26.46 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03951  putative nucleotide sugar epimerase  24.62 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.658541  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4525  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  26.44 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.91 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2890  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  26.13 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.08 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.610294  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.8 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.7 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
336 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1863  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.5 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
308 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3899  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.8 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3030  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  25.93 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.81 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.14 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.03 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.4 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1797  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.48 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.94 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.94 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  25.35 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  29.48 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1401  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  25.34 
 
 
365 aa  77  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0069994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>