More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2975 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
353 aa  726    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.316579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83 
 
 
353 aa  621  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.09 
 
 
352 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000159776  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.69 
 
 
355 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3352  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  55.52 
 
 
355 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.133016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.43 
 
 
355 aa  360  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0680968 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.81 
 
 
355 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 
367 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0777  dNTP-hexose dehydratase/epimerase  32.49 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.955272  normal  0.0951081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 
368 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.329626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.06 
 
 
367 aa  143  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
369 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.1 
 
 
339 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.73 
 
 
339 aa  139  7.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
373 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00197458  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 
354 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 
345 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
680 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.81 
 
 
363 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
339 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.24 
 
 
352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
342 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 
352 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2428  CDP-paratose 2-epimerase  29.44 
 
 
338 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  hitchhiker  0.000207654 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
669 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2871  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
355 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
357 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
357 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.05 
 
 
312 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 
672 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 
672 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
351 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0250  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
363 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
357 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3530  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 
358 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.86 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659255 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.7 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
342 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.22 
 
 
307 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.32 
 
 
362 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
354 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.01 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.29 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 
355 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0259  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
357 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0770236  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.54 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3699  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.61 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.682682  normal  0.543496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0627905  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.06 
 
 
330 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 
685 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.41 
 
 
337 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8193  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.32 
 
 
338 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4211  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.36 
 
 
331 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
315 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
358 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.707519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 
363 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.568981  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
684 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 
354 aa  105  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
354 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2097  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.55 
 
 
347 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.02 
 
 
320 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.01 
 
 
323 aa  104  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.54 
 
 
330 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.67 
 
 
330 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.48 
 
 
352 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.81 
 
 
354 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.25 
 
 
336 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.8 
 
 
329 aa  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1222  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  26.03 
 
 
348 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.89 
 
 
336 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0734  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25 
 
 
335 aa  100  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.290638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1093  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.68 
 
 
335 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1066  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.68 
 
 
335 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1082  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.68 
 
 
335 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.75 
 
 
348 aa  99.4  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
357 aa  99.4  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1669  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.27 
 
 
357 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.75 
 
 
339 aa  99  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.15 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0041  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0865438  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.49 
 
 
362 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  25.28 
 
 
360 aa  97.8  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5840  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.9 
 
 
352 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.481427 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.58 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0595  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.93 
 
 
334 aa  96.7  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1365  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.17 
 
 
335 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.137011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.33 
 
 
336 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.11 
 
 
340 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
314 aa  96.3  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.41 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.83 
 
 
352 aa  95.1  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.97 
 
 
330 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1075  UDP-glucose 4-epimerase  26.36 
 
 
342 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.320061  normal  0.011198 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.66 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>