More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0570 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1348  30S ribosomal protein S9P  100 
 
 		 134 aa  269  9e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.374439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0570  30S ribosomal protein S9P  100 
 
 		 134 aa  269  9e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.270013 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0268  30S ribosomal protein S9P  99.25 
 
 		 134 aa  267  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0636  30S ribosomal protein S9P  92.54 
 
 		 134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1095  30S ribosomal protein S9P  79.85 
 
 		 134 aa  228  2e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0481  30S ribosomal protein S9P  58.21 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2390  30S ribosomal protein S9P  53.38 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000011092  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1241  30S ribosomal protein S9P  52.99 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00137168  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2548  ribosomal protein S9P  50.38 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1426  30S ribosomal protein S9P  51.09 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0327998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2382  30S ribosomal protein S9P  52.24 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000163984  normal  0.637702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1806  30S ribosomal protein S9P  50.38 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1822  30S ribosomal protein S9P  45.86 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0426  ribosomal protein S9P  48.12 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0277  30S ribosomal protein S9P  48.51 
 
 		 132 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2518  30S ribosomal protein S9P  45.11 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535604  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2219  30S ribosomal protein S9P  51.88 
 
 		 133 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1476  ribosomal protein S9P  48.51 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.699246  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2595  30S ribosomal protein S9P  43.61 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.22552  normal  0.0960002 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17519  predicted protein  45.32 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02750  PRCDNA95, putative  46.48 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0301747  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31856  Ribosomal protein S16, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  46.04 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442922  normal  0.257335 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0694  30S ribosomal protein S9P  45.86 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.459392  normal  0.10195 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1972  30S ribosomal protein S9P  45.86 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.038178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2100  30S ribosomal protein S9P  44.36 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73324  40S ribosomal protein S16  45.32 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal  0.0669518 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2330  30S ribosomal protein S9P  42.86 
 
 		 144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000018587  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09468  40S ribosomal protein S16 (Broad)  41.73 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2896  30S ribosomal protein S9P  44.03 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1571  30S ribosomal protein S9P  41.04 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.867321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2142  30S ribosomal protein S9P  46.27 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000924754  hitchhiker  0.000062227 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1049  ribosomal protein S9P  43.28 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0529864  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0425  30S ribosomal protein S9  30.94 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0289267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  37.5 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  34.33 
 
 		 128 aa  67  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  32.8 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  38.2 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  32.59 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  34.81 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  31.19 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  30.48 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  33.08 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  33.04 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  30.53 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  35.34 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  32.82 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  34.31 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  37.65 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  30.53 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  32.48 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  33.01 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  34.31 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  34.09 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  35 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  34.48 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  34.48 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  29.77 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  27.68 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  32.76 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  32.76 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  32.76 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  32.76 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  30.7 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  34.12 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  35.29 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  32.76 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  32.76 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  32.76 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  32.76 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  32.76 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  37.21 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  34.88 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  32.35 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0650  SSU ribosomal protein S9P  32.56 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.4124e-16  normal  0.0939463 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1940  ribosomal protein S9  30.51 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  29.23 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  34.52 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1537  30S ribosomal protein S9  30.6 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611504  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  32.56 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  34.12 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  34.12 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  34.12 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  34.12 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  32.94 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0905  ribosomal protein S9  34.09 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.122737  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1652  30S ribosomal protein S9  31.93 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.386728  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  30.39 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  32.94 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  32.48 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  32.35 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  32.94 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1826  30S ribosomal protein S9  31.93 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000606063  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  30.39 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1472  30S ribosomal protein S9  31.93 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000347675  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  31.46 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>