More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2595 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2595  30S ribosomal protein S9P  100 
 
 		 132 aa  266  5e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.22552  normal  0.0960002 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2518  30S ribosomal protein S9P  87.88 
 
 		 132 aa  241  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535604  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0426  ribosomal protein S9P  84.09 
 
 		 132 aa  232  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2548  ribosomal protein S9P  82.58 
 
 		 132 aa  231  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1822  30S ribosomal protein S9P  83.33 
 
 		 132 aa  226  8e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2390  30S ribosomal protein S9P  61.83 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000011092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0481  30S ribosomal protein S9P  61.07 
 
 		 132 aa  169  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1426  30S ribosomal protein S9P  57.25 
 
 		 134 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0327998 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1806  30S ribosomal protein S9P  55.73 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1241  30S ribosomal protein S9P  54.96 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00137168  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2896  30S ribosomal protein S9P  56.49 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2382  30S ribosomal protein S9P  54.2 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000163984  normal  0.637702 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1476  ribosomal protein S9P  53.44 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.699246  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2219  30S ribosomal protein S9P  48.85 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1095  30S ribosomal protein S9P  45.86 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1348  30S ribosomal protein S9P  43.61 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.374439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0570  30S ribosomal protein S9P  43.61 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.270013 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0268  30S ribosomal protein S9P  43.61 
 
 		 134 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0636  30S ribosomal protein S9P  45.11 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0277  30S ribosomal protein S9P  48.44 
 
 		 132 aa  123  9e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2100  30S ribosomal protein S9P  51.15 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0694  30S ribosomal protein S9P  50.38 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.459392  normal  0.10195 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17519  predicted protein  44.36 
 
 		 143 aa  121  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09468  40S ribosomal protein S16 (Broad)  47.37 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73324  40S ribosomal protein S16  44.85 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal  0.0669518 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1972  30S ribosomal protein S9P  50.38 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.038178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1571  30S ribosomal protein S9P  45.04 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.867321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2330  30S ribosomal protein S9P  48.85 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000018587  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31856  Ribosomal protein S16, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  43.17 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442922  normal  0.257335 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02750  PRCDNA95, putative  43.07 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0301747  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0425  30S ribosomal protein S9  42.03 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0289267 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1049  ribosomal protein S9P  43.75 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0529864  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2142  30S ribosomal protein S9P  41.22 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000924754  hitchhiker  0.000062227 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  42.42 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  40.91 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  40.16 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  39.06 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  37.5 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  35.16 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  37.12 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  38.35 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  39.23 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  38.64 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  37.12 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  36.64 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  37.5 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  37.88 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  38.64 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  37.59 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  40.16 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  35.66 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  35.66 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  38.46 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  36.72 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  35.66 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3156  30S ribosomal protein S9  34.88 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  36.64 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  35.94 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1537  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611504  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  39.69 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  33.59 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  36.43 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  33.86 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  34.85 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0469  30S ribosomal protein S9  34.38 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  35.11 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1546  ribosomal protein S9  34.85 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000425465  hitchhiker  0.00000000000000208113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  35.94 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  34.75 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  33.86 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  33.59 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  33.59 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  33.59 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4112  30S ribosomal protein S9  33.08 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  34.88 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  31.06 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  33.85 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  33.85 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  33.85 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  33.85 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  33.85 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  34.09 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  33.85 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  33.85 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  33.85 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  33.85 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  33.85 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  33.59 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  35.16 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  33.85 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  35.16 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  33.85 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  33.85 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  36.43 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  35.16 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>