More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1806 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1806  30S ribosomal protein S9P  100 
 
 		 133 aa  270  4.0000000000000004e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2219  30S ribosomal protein S9P  79.7 
 
 		 133 aa  220  4e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2382  30S ribosomal protein S9P  75.94 
 
 		 133 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000163984  normal  0.637702 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1241  30S ribosomal protein S9P  74.81 
 
 		 132 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00137168  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2896  30S ribosomal protein S9P  70.99 
 
 		 132 aa  202  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2390  30S ribosomal protein S9P  64.12 
 
 		 134 aa  180  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000011092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1426  30S ribosomal protein S9P  62.69 
 
 		 134 aa  174  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0327998 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0481  30S ribosomal protein S9P  61.83 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0426  ribosomal protein S9P  58.02 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2595  30S ribosomal protein S9P  55.73 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.22552  normal  0.0960002 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2518  30S ribosomal protein S9P  54.96 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535604  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1476  ribosomal protein S9P  57.25 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.699246  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2548  ribosomal protein S9P  56.49 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1822  30S ribosomal protein S9P  54.96 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1348  30S ribosomal protein S9P  50.38 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.374439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0570  30S ribosomal protein S9P  50.38 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.270013 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1095  30S ribosomal protein S9P  50.38 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0268  30S ribosomal protein S9P  50.38 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0277  30S ribosomal protein S9P  52.67 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0636  30S ribosomal protein S9P  47.37 
 
 		 134 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0694  30S ribosomal protein S9P  49.62 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.459392  normal  0.10195 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1972  30S ribosomal protein S9P  48.09 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.038178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2330  30S ribosomal protein S9P  47.33 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000018587  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2100  30S ribosomal protein S9P  48.09 
 
 		 142 aa  123  7e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1571  30S ribosomal protein S9P  46.21 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.867321  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09468  40S ribosomal protein S16 (Broad)  44.53 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73324  40S ribosomal protein S16  43.07 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal  0.0669518 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31856  Ribosomal protein S16, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  45.99 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442922  normal  0.257335 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17519  predicted protein  40.88 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02750  PRCDNA95, putative  42.34 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0301747  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1049  ribosomal protein S9P  47.73 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0529864  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0425  30S ribosomal protein S9  40.15 
 
 		 149 aa  93.6  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0289267 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2142  30S ribosomal protein S9P  42.11 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000924754  hitchhiker  0.000062227 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  43.41 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  40.77 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  39.26 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  41.98 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  39.42 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  39.06 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  40.62 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  38.35 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  39.55 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  39.55 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  39.39 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  40 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  36.57 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1940  ribosomal protein S9  38.66 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  37.01 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  38.06 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  37.4 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  37.6 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  37.8 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  36.76 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  37.5 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  40.91 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  36.92 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  36.92 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  36.92 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  40.15 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  36.3 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  39.06 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  34.07 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  35.38 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  37.5 
 
 		 162 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4944  ribosomal protein S9  38.98 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  39.06 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  35.88 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  36.03 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  39.47 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  40.35 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  36.03 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  36.36 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1537  30S ribosomal protein S9  38.94 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611504  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  38.06 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  39.02 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  38.76 
 
 		 160 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  36.72 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  36.72 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  37.5 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  34.09 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  35.34 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  35.43 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0650  SSU ribosomal protein S9P  36.22 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.4124e-16  normal  0.0939463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  35.94 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  35.43 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  35.94 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  35.43 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0753  30S ribosomal protein S9  37.01 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000116915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  36.43 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3156  30S ribosomal protein S9  32.56 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  36.64 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  34.65 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  36.72 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  36.72 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0722  ribosomal protein S9  32.31 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  36.5 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  36.5 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>