More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2518 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2518  30S ribosomal protein S9P  100 
 
 
132 aa  267  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535604  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2595  30S ribosomal protein S9P  87.88 
 
 
132 aa  241  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.22552  normal  0.0960002 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0426  ribosomal protein S9P  83.33 
 
 
132 aa  234  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2548  ribosomal protein S9P  81.82 
 
 
132 aa  231  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1822  30S ribosomal protein S9P  82.58 
 
 
132 aa  226  7e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2390  30S ribosomal protein S9P  65.65 
 
 
134 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000011092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0481  30S ribosomal protein S9P  61.07 
 
 
132 aa  167  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1426  30S ribosomal protein S9P  56.49 
 
 
134 aa  159  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0327998 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1806  30S ribosomal protein S9P  54.96 
 
 
133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1241  30S ribosomal protein S9P  54.2 
 
 
132 aa  149  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00137168  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2382  30S ribosomal protein S9P  54.96 
 
 
133 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000163984  normal  0.637702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2896  30S ribosomal protein S9P  53.44 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00665181  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1476  ribosomal protein S9P  53.44 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.699246  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2219  30S ribosomal protein S9P  50.38 
 
 
133 aa  136  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1348  30S ribosomal protein S9P  45.11 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.374439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0570  30S ribosomal protein S9P  45.11 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.270013 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1095  30S ribosomal protein S9P  46.62 
 
 
134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0277  30S ribosomal protein S9P  51.56 
 
 
132 aa  130  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0268  30S ribosomal protein S9P  44.36 
 
 
134 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0636  30S ribosomal protein S9P  45.11 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1571  30S ribosomal protein S9P  47.33 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.867321  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1972  30S ribosomal protein S9P  52.67 
 
 
146 aa  124  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.038178  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0694  30S ribosomal protein S9P  51.15 
 
 
146 aa  124  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.459392  normal  0.10195 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73324  40S ribosomal protein S16  45.59 
 
 
142 aa  123  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal  0.0669518 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2330  30S ribosomal protein S9P  50.38 
 
 
144 aa  122  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000018587  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17519  predicted protein  46.62 
 
 
143 aa  122  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09468  40S ribosomal protein S16 (Broad)  46.38 
 
 
143 aa  120  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97674  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2100  30S ribosomal protein S9P  51.15 
 
 
142 aa  120  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31856  Ribosomal protein S16, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  45.32 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442922  normal  0.257335 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02750  PRCDNA95, putative  46.72 
 
 
140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0301747  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0425  30S ribosomal protein S9  42.75 
 
 
149 aa  104  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0289267 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1049  ribosomal protein S9P  44.53 
 
 
137 aa  101  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0529864  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2142  30S ribosomal protein S9P  41.22 
 
 
137 aa  93.6  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000924754  hitchhiker  0.000062227 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  40.91 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  39.06 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  40.15 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  40.31 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  40.62 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  39.69 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  40.77 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  38.64 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  39.23 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  39.39 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  37.12 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  38.17 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  37.88 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  38.17 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  38.17 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  37.78 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  40.16 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  39.23 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  39.06 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  36.15 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  37.5 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  38.76 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  35.66 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  36.72 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  39.55 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  36.64 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  39.06 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  39.06 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  36.72 
 
 
130 aa  67  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  37.5 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  35.11 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1537  30S ribosomal protein S9  40 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611504  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  36.43 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  36.72 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  34.09 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  37.69 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  37.21 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3163  30S ribosomal protein S9  35.16 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.247444  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1546  ribosomal protein S9  34.31 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000425465  hitchhiker  0.00000000000000208113 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  35.43 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  33.85 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  35.38 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  35.38 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  35.38 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  35.38 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>