More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0722 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 128 aa  260  4e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  77.34 
 
 		 128 aa  209  9e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  74.22 
 
 		 128 aa  199  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 		 128 aa  160  6e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  60.94 
 
 		 128 aa  160  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  64.84 
 
 		 128 aa  160  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 		 128 aa  159  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 		 128 aa  159  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 129 aa  149  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  57.85 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0881  ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 133 aa  140  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 161 aa  139  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  59.5 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1649  30S ribosomal protein S9  61.42 
 
 		 129 aa  137  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0376  30S ribosomal protein S9  57.03 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0349  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 133 aa  134  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16511  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0633365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  57.85 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2205  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 135 aa  133  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1982  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 133 aa  133  8e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0810268  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23301  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  54.33 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  53.12 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  55.37 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  54.33 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17131  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453537  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1624  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.567552  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17391  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 		 136 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 173 aa  130  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  52.34 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1598  30S ribosomal protein S9  51.16 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158082  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  54.33 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17231  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  49.19 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  51.54 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  57.02 
 
 		 170 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  50.77 
 
 		 132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 180 aa  127  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  49.19 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  49.19 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  56.56 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  50.81 
 
 		 131 aa  126  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 		 137 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2354  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0958602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2876  ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0513337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0738  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.211677  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0385  30S ribosomal protein S9  48.84 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.704674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 		 158 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1320  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 		 137 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540344  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  57.85 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19771  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  52.89 
 
 		 264 aa  124  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1652  30S ribosomal protein S9  48.06 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.386728  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1102  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 135 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  52 
 
 		 174 aa  124  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1826  30S ribosomal protein S9  48.06 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000606063  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0912  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  49.19 
 
 		 160 aa  124  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1472  30S ribosomal protein S9  48.06 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000347675  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  47.58 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1908  ribosomal protein S9  46.51 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>