More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1031 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 132 aa  268  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  74.24 
 
 		 132 aa  216  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  73.13 
 
 		 134 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  73.13 
 
 		 134 aa  193  7e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  66.92 
 
 		 135 aa  176  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  63.08 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  61.24 
 
 		 131 aa  153  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  58.59 
 
 		 130 aa  153  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1940  ribosomal protein S9  60.61 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  60.15 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1735  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0401133 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  59.54 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  58.59 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  58.59 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  58.59 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1537  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611504  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  58.59 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  59.38 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  56.25 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0605  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0501  30S ribosomal protein S9  52.27 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0056  SSU ribosomal protein S9P  54.55 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0626  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  58.59 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  58.59 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  57.03 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  52.71 
 
 		 134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  51.94 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5913  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.208895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf385  30S ribosomal protein S9  56.3 
 
 		 132 aa  137  3e-32  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0579956  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  54.96 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  54.26 
 
 		 132 aa  136  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 173 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4677  ribosomal protein S9  53.03 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4052  30S ribosomal protein S9  53.03 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.809908  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2876  ribosomal protein S9  50.76 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0513337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3766  30S ribosomal protein S9  51.52 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  54.14 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2424  SSU ribosomal protein S9P  59.38 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0647  30S ribosomal protein S9  51.52 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2639  30S ribosomal protein S9  53.03 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4112  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0197  30S ribosomal protein S9  51.52 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  57.03 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0680  30S ribosomal protein S9  51.52 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000222538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  54.14 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3995  ribosomal protein S9  51.16 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000512267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0382  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0184231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0367  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000448381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  57.81 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  51.52 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  53.38 
 
 		 130 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  51.16 
 
 		 130 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0600  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000648007  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0574  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  53.38 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  53.38 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  53.38 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  52.27 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  53.38 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  53.38 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  53.38 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  53.38 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  53.38 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  53.38 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  53.38 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1116  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2520  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  54.69 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2342  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3377  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000325455  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  52.34 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3420  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000202027  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0254  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0722  ribosomal protein S9  52.27 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3413  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0107857  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  52.63 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3163  30S ribosomal protein S9  54.2 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.247444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  50.76 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>