More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1341 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
134 aa  270  5.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  99.25 
 
 
134 aa  268  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  72.59 
 
 
135 aa  199  9e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  73.13 
 
 
132 aa  193  7e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  62.69 
 
 
132 aa  175  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  63.64 
 
 
131 aa  160  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  63.43 
 
 
130 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  64.71 
 
 
130 aa  155  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  61.19 
 
 
130 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  62.69 
 
 
130 aa  155  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  61.19 
 
 
130 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  59.7 
 
 
131 aa  151  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  59.7 
 
 
131 aa  151  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1735  30S ribosomal protein S9  59.7 
 
 
131 aa  152  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0401133 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  61.19 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  58.02 
 
 
130 aa  147  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1940  ribosomal protein S9  58.96 
 
 
129 aa  146  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  58.59 
 
 
130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  57.46 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 
130 aa  143  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  55.91 
 
 
130 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 
130 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  57.46 
 
 
130 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  60.47 
 
 
132 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2761  30S ribosomal protein S9  52.05 
 
 
143 aa  141  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2634  30S ribosomal protein S9  52.05 
 
 
143 aa  141  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1537  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 
128 aa  141  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611504  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  53.85 
 
 
130 aa  141  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  56.72 
 
 
130 aa  141  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  56.72 
 
 
130 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  56.72 
 
 
130 aa  141  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  56.72 
 
 
130 aa  141  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  140  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  56.72 
 
 
130 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  141  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  56.72 
 
 
130 aa  141  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  56.72 
 
 
130 aa  141  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  57.69 
 
 
132 aa  140  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 
130 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 
130 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  60.16 
 
 
131 aa  140  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 
130 aa  140  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf385  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 
132 aa  140  7e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0579956  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  58.73 
 
 
170 aa  140  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0382  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 
130 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0184231  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0367  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 
130 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000448381  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  58.21 
 
 
130 aa  139  9e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  54.33 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  55.97 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  55.97 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  55.97 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 
136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  52.99 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  53.91 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  54.33 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 
130 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  52.34 
 
 
130 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  53.12 
 
 
130 aa  138  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 
130 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  56.25 
 
 
130 aa  137  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  57.46 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  53.12 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  54.62 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  53.73 
 
 
129 aa  137  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  54.48 
 
 
129 aa  137  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  52.34 
 
 
130 aa  137  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  53.12 
 
 
130 aa  137  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  53.91 
 
 
132 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  54.48 
 
 
131 aa  136  8.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2520  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2342  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5913  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 
130 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.208895  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 
130 aa  135  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  57.35 
 
 
131 aa  136  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1116  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3163  30S ribosomal protein S9  53.12 
 
 
130 aa  135  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.247444  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3377  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000325455  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0680  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 
130 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000222538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0647  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 
130 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00285977  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0254  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>