More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2363 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
130 aa  262  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
130 aa  262  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  78.46 
 
 
130 aa  209  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  74.62 
 
 
130 aa  208  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  76.92 
 
 
130 aa  205  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  71.54 
 
 
130 aa  194  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  71.54 
 
 
132 aa  193  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  70 
 
 
130 aa  191  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  70 
 
 
130 aa  191  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  73.85 
 
 
130 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  73.85 
 
 
130 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  73.85 
 
 
130 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  73.85 
 
 
130 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  73.85 
 
 
130 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  73.85 
 
 
130 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  73.85 
 
 
130 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  73.08 
 
 
130 aa  185  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  73.08 
 
 
130 aa  185  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  73.08 
 
 
130 aa  184  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  73.08 
 
 
130 aa  184  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  70 
 
 
130 aa  184  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  70 
 
 
130 aa  184  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  70 
 
 
130 aa  183  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  70.77 
 
 
130 aa  183  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  66.15 
 
 
130 aa  181  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  70.54 
 
 
132 aa  181  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  67.44 
 
 
131 aa  180  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  67.44 
 
 
131 aa  180  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  65.38 
 
 
130 aa  177  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  65.38 
 
 
130 aa  176  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  66.92 
 
 
130 aa  176  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  65.38 
 
 
130 aa  176  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  65.38 
 
 
130 aa  176  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  175  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  64.62 
 
 
130 aa  174  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  174  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  173  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  173  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  173  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  173  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  63.85 
 
 
130 aa  173  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  173  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  173  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  173  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  173  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  173  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  173  9e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  63.28 
 
 
131 aa  172  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  170  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  64.89 
 
 
131 aa  170  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  170  5.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  170  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  169  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  60 
 
 
130 aa  169  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  64.62 
 
 
130 aa  169  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  168  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0753  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  168  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000116915  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  62.31 
 
 
130 aa  168  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  63.08 
 
 
130 aa  168  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  62.31 
 
 
130 aa  167  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  62.31 
 
 
130 aa  167  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  62.31 
 
 
130 aa  167  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  68 
 
 
130 aa  166  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  62.31 
 
 
130 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  165  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0748  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000172866  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4221  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000135609  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4442  ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  164  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  60 
 
 
130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  60 
 
 
130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3594  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000165532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 
130 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  66.14 
 
 
131 aa  163  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0727  30S ribosomal protein S9  66.67 
 
 
131 aa  161  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  62.31 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  62.5 
 
 
130 aa  161  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0257  30S ribosomal protein S9  70.77 
 
 
130 aa  159  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000068634  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  60 
 
 
130 aa  157  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>