More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1537 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1537  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
128 aa  257  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611504  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1940  ribosomal protein S9  83.46 
 
 
129 aa  216  8.999999999999998e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1735  30S ribosomal protein S9  66.14 
 
 
131 aa  170  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0401133 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2761  30S ribosomal protein S9  52.86 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2634  30S ribosomal protein S9  52.86 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
132 aa  144  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 
134 aa  142  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 
134 aa  141  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  56.69 
 
 
130 aa  141  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  140  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2876  ribosomal protein S9  54.76 
 
 
129 aa  140  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0513337  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  53.97 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  55.56 
 
 
132 aa  136  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 
135 aa  135  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  53.17 
 
 
130 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 
130 aa  136  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2043  ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  136  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  56.25 
 
 
131 aa  135  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  52.38 
 
 
130 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 
130 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  54.76 
 
 
130 aa  134  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0753  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 
130 aa  134  5e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000116915  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  133  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0748  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000172866  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  53.17 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0542  ribosomal protein S9  57.94 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4221  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000135609  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0253  30S ribosomal protein S9  50.38 
 
 
139 aa  131  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000656502  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1940  30S ribosomal protein S9  50.38 
 
 
139 aa  131  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000532731  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3163  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
130 aa  131  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.247444  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2206  SSU ribosomal protein S9P  53.54 
 
 
129 aa  130  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.453357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 
130 aa  130  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  130  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  53.97 
 
 
130 aa  130  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3594  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
130 aa  130  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000165532  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  51.97 
 
 
130 aa  129  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  54.76 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0014  ribosomal protein S9  54.62 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2076  ribosomal protein S9  54.33 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  55.47 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  50.79 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  50 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4052  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.809908  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  55.47 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  56 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  53.17 
 
 
130 aa  128  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 
130 aa  128  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2788  ribosomal protein S9  57.94 
 
 
130 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000140519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
130 aa  128  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  50 
 
 
131 aa  128  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 
160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 
159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0626  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  52.34 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0605  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3377  30S ribosomal protein S9  49.19 
 
 
130 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000325455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2520  30S ribosomal protein S9  49.19 
 
 
130 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0254  30S ribosomal protein S9  49.19 
 
 
130 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>