More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2297 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  100 
 
 		 130 aa  266  8.999999999999999e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  66.15 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  64.62 
 
 		 130 aa  184  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  65.38 
 
 		 130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  64.62 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 		 130 aa  173  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 		 130 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 		 130 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  60 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  61.07 
 
 		 131 aa  168  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2424  SSU ribosomal protein S9P  66.15 
 
 		 130 aa  163  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  60.47 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  59.38 
 
 		 131 aa  161  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  60.47 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  60.98 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  153  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  153  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0727  30S ribosomal protein S9  62.02 
 
 		 131 aa  153  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  153  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2587  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 		 138 aa  153  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  153  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  153  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  58.59 
 
 		 132 aa  153  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 172 aa  151  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 173 aa  150  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  61.48 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  55.56 
 
 		 134 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  59.5 
 
 		 171 aa  149  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0257  30S ribosomal protein S9  62.31 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000068634  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  59.06 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  57.02 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  51.18 
 
 		 129 aa  147  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  61.48 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  59.02 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  53.85 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  58.68 
 
 		 167 aa  147  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  51.18 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  56.2 
 
 		 162 aa  146  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 166 aa  146  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  53.97 
 
 		 138 aa  146  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  146  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  146  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  146  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  146  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  146  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  146  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>