More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6017 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0615  SSU ribosomal protein S9P  88.15 
 
 		 135 aa  225  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  0.442005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  78.2 
 
 		 139 aa  206  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  76.38 
 
 		 162 aa  205  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  79.03 
 
 		 174 aa  205  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  73.64 
 
 		 170 aa  199  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  75.2 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  75 
 
 		 171 aa  189  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  75.81 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  75.81 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  75.81 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  76 
 
 		 162 aa  187  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  72.58 
 
 		 171 aa  185  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  72.58 
 
 		 166 aa  185  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  68.75 
 
 		 172 aa  183  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  75.2 
 
 		 161 aa  184  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  76.03 
 
 		 167 aa  183  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  75.2 
 
 		 162 aa  183  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  69.53 
 
 		 173 aa  183  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0972  ribosomal protein S9  67.41 
 
 		 173 aa  179  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0537605 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  69.17 
 
 		 169 aa  178  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  71.77 
 
 		 162 aa  178  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  70.16 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  70.16 
 
 		 154 aa  177  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6564  ribosomal protein S9  75 
 
 		 216 aa  177  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0743813  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  68.8 
 
 		 163 aa  175  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13479  30S ribosomal protein S9  75 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0104915  hitchhiker  0.000207065 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  65.93 
 
 		 169 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2917  30S ribosomal protein S9  70.16 
 
 		 168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954546  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  65.38 
 
 		 171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4283  ribosomal protein S9  72.09 
 
 		 171 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0662  ribosomal protein S9  77.6 
 
 		 165 aa  167  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4253  30S ribosomal protein S9  71.77 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3863  30S ribosomal protein S9  71.77 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0721  30S ribosomal protein S9  72.58 
 
 		 167 aa  164  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  64.75 
 
 		 130 aa  157  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23240  SSU ribosomal protein S9P  69.92 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  59.35 
 
 		 264 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  62.3 
 
 		 130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  57.72 
 
 		 130 aa  143  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  57.72 
 
 		 130 aa  143  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  53.49 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  59.02 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  57.72 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  56.1 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  56.1 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  56.56 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 130 aa  137  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  58.54 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  53.66 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  60.32 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  56.56 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0676  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0430  ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.912667  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0727  30S ribosomal protein S9  62.02 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341683  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0253  ribosomal protein S9  63.41 
 
 		 162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 130 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 138 aa  133  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1694  30S ribosomal protein S9  62.6 
 
 		 163 aa  133  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.390598  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  57.94 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  51.54 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  50.77 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  50.77 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>