More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0727 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0727  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
131 aa  259  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  71.32 
 
 
130 aa  189  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  70.54 
 
 
130 aa  188  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  70.54 
 
 
130 aa  186  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  66.67 
 
 
130 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  66.67 
 
 
130 aa  183  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  66.67 
 
 
130 aa  183  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  67.44 
 
 
130 aa  181  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2424  SSU ribosomal protein S9P  75.97 
 
 
130 aa  181  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332574  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  66.67 
 
 
130 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  70.54 
 
 
130 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  65.12 
 
 
130 aa  176  8e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  65.12 
 
 
130 aa  176  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  65.12 
 
 
130 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  65.12 
 
 
130 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  62.02 
 
 
130 aa  174  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0257  30S ribosomal protein S9  70.54 
 
 
130 aa  174  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000068634  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  67.94 
 
 
130 aa  173  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  66.41 
 
 
131 aa  172  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  63.08 
 
 
131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  63.57 
 
 
130 aa  169  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  65.12 
 
 
130 aa  169  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  64.34 
 
 
130 aa  168  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  65.89 
 
 
130 aa  168  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  62.02 
 
 
130 aa  167  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  61.07 
 
 
131 aa  167  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  61.07 
 
 
131 aa  167  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  65.12 
 
 
130 aa  167  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  65.12 
 
 
130 aa  167  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  65.12 
 
 
130 aa  167  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  65.12 
 
 
130 aa  167  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  65.12 
 
 
130 aa  167  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  65.12 
 
 
130 aa  167  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  65.12 
 
 
130 aa  167  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  65.65 
 
 
130 aa  166  7e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  60 
 
 
132 aa  166  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  64.34 
 
 
130 aa  165  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  64.34 
 
 
130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  64.34 
 
 
130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  61.36 
 
 
132 aa  161  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  62.6 
 
 
131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  58.14 
 
 
130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  61.07 
 
 
131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  62.6 
 
 
170 aa  159  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  64.12 
 
 
130 aa  158  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  62.02 
 
 
135 aa  156  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  65.6 
 
 
131 aa  155  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  59.68 
 
 
174 aa  152  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0014  ribosomal protein S9  59.06 
 
 
130 aa  152  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  149  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  61.6 
 
 
166 aa  150  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  58.06 
 
 
139 aa  149  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 
158 aa  149  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  148  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  58.14 
 
 
180 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  56.49 
 
 
130 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  58.96 
 
 
134 aa  147  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  58.52 
 
 
135 aa  148  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  60.47 
 
 
130 aa  148  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  59.52 
 
 
134 aa  148  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  55.81 
 
 
130 aa  147  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0141  30S ribosomal protein S9  62.02 
 
 
130 aa  147  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  58.96 
 
 
134 aa  147  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  147  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  147  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 
173 aa  147  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  147  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  147  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  147  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  147  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  147  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  147  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  55.04 
 
 
130 aa  147  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 
159 aa  146  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  54.26 
 
 
130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  54.26 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 
130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  61.6 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  55.3 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3995  ribosomal protein S9  55.3 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000512267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  63.93 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  57.25 
 
 
264 aa  144  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  144  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  57.26 
 
 
162 aa  144  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  61.6 
 
 
162 aa  144  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>