More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2151 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  70.81 
 
 		 166 aa  230  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  70.89 
 
 		 163 aa  228  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  65.82 
 
 		 160 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  65.19 
 
 		 158 aa  218  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  65.19 
 
 		 158 aa  218  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  64.02 
 
 		 164 aa  217  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  64.56 
 
 		 158 aa  217  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  65.19 
 
 		 160 aa  216  7e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  65.19 
 
 		 160 aa  216  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  63.41 
 
 		 164 aa  216  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  63.64 
 
 		 165 aa  214  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  64.78 
 
 		 159 aa  214  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  71.83 
 
 		 180 aa  211  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  63.8 
 
 		 161 aa  210  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  67.81 
 
 		 162 aa  208  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  62.11 
 
 		 161 aa  208  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  62.26 
 
 		 161 aa  207  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  63.64 
 
 		 162 aa  208  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  64.2 
 
 		 160 aa  206  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  62.89 
 
 		 159 aa  206  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  63.25 
 
 		 165 aa  206  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  62.03 
 
 		 158 aa  205  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  64.52 
 
 		 155 aa  204  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  62.03 
 
 		 158 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  67.83 
 
 		 162 aa  204  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  62.26 
 
 		 159 aa  204  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  62.03 
 
 		 155 aa  203  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  61.39 
 
 		 158 aa  203  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  62.26 
 
 		 160 aa  203  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  63.23 
 
 		 155 aa  203  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  65.73 
 
 		 161 aa  202  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  65.73 
 
 		 161 aa  202  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  61.88 
 
 		 160 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  61.73 
 
 		 160 aa  202  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  65.73 
 
 		 161 aa  201  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  62.82 
 
 		 157 aa  200  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  71.11 
 
 		 188 aa  200  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  60.76 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  61.39 
 
 		 155 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  64.34 
 
 		 161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  63.57 
 
 		 130 aa  170  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1018  30S ribosomal protein S9  57.58 
 
 		 152 aa  164  4e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  62.9 
 
 		 130 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  58.91 
 
 		 130 aa  160  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0821  30S ribosomal protein S9  54.74 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.766995  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 130 aa  157  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  62.6 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  62.6 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  58.14 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 129 aa  156  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  154  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0839  ribosomal protein S9  57.55 
 
 		 145 aa  153  7e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 130 aa  154  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0066  30S ribosomal protein S9  57.25 
 
 		 151 aa  153  9e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  60.66 
 
 		 131 aa  153  9e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  58.14 
 
 		 130 aa  153  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44376  Putative mitochondrial ribosomal protein S9  56.3 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.272268  normal  0.0615746 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0753  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000116915  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  58.14 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 130 aa  151  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 130 aa  151  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  151  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  151  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  49.69 
 
 		 170 aa  150  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  60.98 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  54.48 
 
 		 173 aa  148  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  148  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  57.02 
 
 		 128 aa  147  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 130 aa  147  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 130 aa  147  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 130 aa  147  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  147  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2342  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0254  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3420  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000202027  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1116  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3377  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000325455  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3413  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0107857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2520  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>