More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2425 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
164 aa  330  7.000000000000001e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  81.1 
 
 
164 aa  264  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  77.44 
 
 
161 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  80 
 
 
160 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  78.88 
 
 
160 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  78.88 
 
 
160 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  76.83 
 
 
159 aa  241  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  64.5 
 
 
162 aa  221  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  68.29 
 
 
158 aa  220  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  68.29 
 
 
158 aa  220  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  68.9 
 
 
158 aa  220  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  68.48 
 
 
165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  66.47 
 
 
160 aa  218  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  68.35 
 
 
163 aa  218  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  71.43 
 
 
155 aa  217  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  63.41 
 
 
158 aa  216  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  66.46 
 
 
161 aa  215  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  68.32 
 
 
155 aa  213  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  66.88 
 
 
155 aa  212  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  66.46 
 
 
159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  66.46 
 
 
159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  64.07 
 
 
160 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  66.88 
 
 
157 aa  211  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  66.67 
 
 
166 aa  210  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  64.02 
 
 
158 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  64.81 
 
 
165 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  63.03 
 
 
160 aa  210  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  63.41 
 
 
158 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  72.46 
 
 
188 aa  208  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  68.12 
 
 
155 aa  207  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  64.24 
 
 
158 aa  207  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  63.41 
 
 
158 aa  207  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  71.11 
 
 
180 aa  207  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  62.8 
 
 
161 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  62.2 
 
 
160 aa  202  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  63.35 
 
 
161 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  61.49 
 
 
161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  60.87 
 
 
161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  60.87 
 
 
161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  60.87 
 
 
162 aa  191  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  61.49 
 
 
162 aa  191  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  65.85 
 
 
130 aa  168  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0821  30S ribosomal protein S9  55.17 
 
 
149 aa  161  3e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.766995  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1018  30S ribosomal protein S9  60 
 
 
152 aa  159  2e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 
130 aa  157  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0066  30S ribosomal protein S9  58.78 
 
 
151 aa  154  3e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  59.68 
 
 
129 aa  155  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44376  Putative mitochondrial ribosomal protein S9  60.74 
 
 
137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.272268  normal  0.0615746 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  59.68 
 
 
129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 
130 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0839  ribosomal protein S9  55.8 
 
 
145 aa  152  1e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 
130 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 
130 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 
130 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  54.26 
 
 
130 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  148  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0753  30S ribosomal protein S9  54.26 
 
 
130 aa  147  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000116915  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  55.65 
 
 
130 aa  147  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  147  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  147  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 
130 aa  144  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  144  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  53.1 
 
 
173 aa  144  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 
130 aa  144  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2043  ribosomal protein S9  52.71 
 
 
130 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  143  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  54.4 
 
 
131 aa  143  9e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  57.94 
 
 
264 aa  143  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  54.03 
 
 
130 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 
130 aa  143  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  54.03 
 
 
130 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  54.03 
 
 
130 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 
130 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  54.03 
 
 
130 aa  141  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 
130 aa  141  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 
130 aa  141  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 
130 aa  141  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 
130 aa  141  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 
130 aa  141  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  54.03 
 
 
130 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 
130 aa  141  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 
130 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  58.87 
 
 
130 aa  141  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  53.12 
 
 
133 aa  141  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>