More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0321 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
130 aa  259  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  72.31 
 
 
130 aa  201  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  74.05 
 
 
131 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0257  30S ribosomal protein S9  80 
 
 
130 aa  187  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000068634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  67.69 
 
 
130 aa  187  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  68.46 
 
 
130 aa  184  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  66.92 
 
 
130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  67.69 
 
 
130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  68.46 
 
 
130 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  65.38 
 
 
130 aa  178  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  66.92 
 
 
130 aa  176  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  66.92 
 
 
130 aa  176  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  64.62 
 
 
130 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  64.62 
 
 
132 aa  173  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  170  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2424  SSU ribosomal protein S9P  70.77 
 
 
130 aa  170  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332574  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  62.79 
 
 
131 aa  169  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  62.79 
 
 
131 aa  169  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0727  30S ribosomal protein S9  66.67 
 
 
131 aa  165  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  164  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 
130 aa  164  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  61.54 
 
 
130 aa  163  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 
130 aa  163  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  60 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0905  ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  161  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.122737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  161  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  64.18 
 
 
134 aa  161  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  62.31 
 
 
130 aa  161  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  161  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  161  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 
130 aa  160  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 
130 aa  160  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 
130 aa  160  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 
130 aa  160  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 
130 aa  160  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 
130 aa  160  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 
130 aa  160  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  160  7e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  159  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  60 
 
 
130 aa  159  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  158  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  158  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  63.43 
 
 
134 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  59.23 
 
 
130 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  158  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  158  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  157  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  158  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  158  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  158  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  157  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  57.69 
 
 
130 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  158  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  158  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  158  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  158  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  157  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  157  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  157  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  157  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  63.49 
 
 
132 aa  157  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  157  7e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  157  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  157  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  157  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  157  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  157  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  56.15 
 
 
130 aa  156  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  59.06 
 
 
129 aa  156  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  57.69 
 
 
130 aa  156  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3995  ribosomal protein S9  61.9 
 
 
132 aa  155  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000512267 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 
130 aa  155  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  56.15 
 
 
130 aa  155  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  59.06 
 
 
129 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  60.16 
 
 
131 aa  155  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  56.92 
 
 
130 aa  155  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  154  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  58.14 
 
 
132 aa  154  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  62.4 
 
 
130 aa  154  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  60.63 
 
 
131 aa  154  4e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  60 
 
 
130 aa  153  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>