More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0048 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 130 aa  263  8e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  72.31 
 
 		 130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  70 
 
 		 130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  73.85 
 
 		 130 aa  196  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  72.31 
 
 		 130 aa  194  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  68.46 
 
 		 130 aa  183  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 		 130 aa  169  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 		 130 aa  166  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 129 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1668  ribosomal protein S9  63.85 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000154129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 166 aa  149  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 264 aa  149  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 161 aa  147  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 161 aa  147  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  54.62 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 161 aa  147  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  58.87 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 155 aa  146  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 155 aa  146  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 161 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4442  ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  56 
 
 		 132 aa  144  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 158 aa  143  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 164 aa  143  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  56.91 
 
 		 170 aa  142  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  54.4 
 
 		 131 aa  141  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>