More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0342 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  100 
 
 		 170 aa  341  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  72.67 
 
 		 162 aa  215  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  70.37 
 
 		 162 aa  214  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  65.68 
 
 		 162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  69.93 
 
 		 173 aa  208  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  62.35 
 
 		 169 aa  201  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  59.88 
 
 		 172 aa  201  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  73.64 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  61.9 
 
 		 168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  66.89 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 163 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0662  ribosomal protein S9  70 
 
 		 165 aa  193  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  70.08 
 
 		 162 aa  191  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  61.11 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  61.35 
 
 		 169 aa  191  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  58.82 
 
 		 171 aa  188  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  56.14 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0972  ribosomal protein S9  62.42 
 
 		 173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0537605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  72.13 
 
 		 171 aa  187  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4283  ribosomal protein S9  67.1 
 
 		 171 aa  187  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2917  30S ribosomal protein S9  64.24 
 
 		 168 aa  187  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954546  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  71.9 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  71.9 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  71.9 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  69.42 
 
 		 174 aa  184  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  66.94 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0721  30S ribosomal protein S9  66.04 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  55.95 
 
 		 167 aa  177  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  69.92 
 
 		 161 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0615  SSU ribosomal protein S9P  72.44 
 
 		 135 aa  174  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  0.442005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13479  30S ribosomal protein S9  72.95 
 
 		 151 aa  170  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0104915  hitchhiker  0.000207065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23240  SSU ribosomal protein S9P  61.15 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  64.46 
 
 		 154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0253  ribosomal protein S9  61.73 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  65.85 
 
 		 130 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  65.04 
 
 		 130 aa  160  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6564  ribosomal protein S9  68.6 
 
 		 216 aa  159  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0743813  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  63.41 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1694  30S ribosomal protein S9  64 
 
 		 163 aa  157  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.390598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  64.23 
 
 		 130 aa  157  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  63.41 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4253  30S ribosomal protein S9  69.67 
 
 		 154 aa  156  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  60.98 
 
 		 130 aa  155  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3863  30S ribosomal protein S9  68.85 
 
 		 154 aa  155  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  65.41 
 
 		 131 aa  154  7e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  63.11 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 		 130 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 		 130 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  65.04 
 
 		 130 aa  151  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 		 130 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  49.69 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  61.79 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  63.41 
 
 		 130 aa  150  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  63.71 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  54.42 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  60.98 
 
 		 130 aa  147  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  57.72 
 
 		 130 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  60.16 
 
 		 131 aa  147  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  60.16 
 
 		 131 aa  147  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  59.35 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  59.35 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  59.35 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  58.54 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  58.54 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  58.54 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  58.54 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  58.54 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  58.54 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  58.54 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  58.54 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  62.1 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  50.98 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  57.14 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  57.72 
 
 		 130 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  58.06 
 
 		 131 aa  143  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  61.79 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  57.72 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  57.72 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  53.38 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  59.35 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  58.54 
 
 		 132 aa  142  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  46.3 
 
 		 155 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  47.53 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  49.07 
 
 		 159 aa  141  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  48.77 
 
 		 155 aa  141  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  46.3 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 128 aa  140  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1320  30S ribosomal protein S9  54.29 
 
 		 137 aa  140  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540344  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  58.73 
 
 		 134 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  46.3 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  58.73 
 
 		 134 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  46.95 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  46.3 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>