More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0600 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 173 aa  350  4e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  72.25 
 
 		 172 aa  262  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  65.9 
 
 		 169 aa  224  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  65.19 
 
 		 166 aa  216  8.999999999999998e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  62.43 
 
 		 169 aa  215  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  63.52 
 
 		 168 aa  212  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  69.93 
 
 		 170 aa  208  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  67.32 
 
 		 162 aa  207  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  64.74 
 
 		 162 aa  206  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4283  ribosomal protein S9  68 
 
 		 171 aa  203  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  67.53 
 
 		 162 aa  202  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0972  ribosomal protein S9  63.87 
 
 		 173 aa  200  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0537605 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  62.66 
 
 		 171 aa  199  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  60.34 
 
 		 163 aa  199  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  64.24 
 
 		 162 aa  197  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2917  30S ribosomal protein S9  63.58 
 
 		 168 aa  190  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954546  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0662  ribosomal protein S9  63.22 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  69.53 
 
 		 135 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0721  30S ribosomal protein S9  64.15 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  66.41 
 
 		 162 aa  181  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23240  SSU ribosomal protein S9P  63.29 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457375  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  65.04 
 
 		 174 aa  175  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  53.45 
 
 		 171 aa  171  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0615  SSU ribosomal protein S9P  69.23 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  0.442005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  58.5 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  58.5 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  58.5 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  65.04 
 
 		 139 aa  167  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 167 aa  164  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0253  ribosomal protein S9  62.82 
 
 		 162 aa  164  4e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1694  30S ribosomal protein S9  62.82 
 
 		 163 aa  165  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.390598  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  60.74 
 
 		 171 aa  165  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  56.05 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  62.1 
 
 		 130 aa  153  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  60.8 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  61.79 
 
 		 130 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6564  ribosomal protein S9  63.93 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0743813  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  54.48 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  61.29 
 
 		 130 aa  148  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 130 aa  147  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  147  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  63.2 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13479  30S ribosomal protein S9  65.04 
 
 		 151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0104915  hitchhiker  0.000207065 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  50.63 
 
 		 164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  52 
 
 		 264 aa  144  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 		 138 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  53.1 
 
 		 164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  60.8 
 
 		 130 aa  144  8.000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1320  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 		 137 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540344  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  58.87 
 
 		 131 aa  143  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  53.1 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  53.1 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  53.1 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  49.68 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  142  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  50.68 
 
 		 161 aa  141  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 		 128 aa  140  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  59.68 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 130 aa  140  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  57.14 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  50.93 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  53.15 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 130 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  62.5 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2205  30S ribosomal protein S9  58.73 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  58.33 
 
 		 131 aa  139  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 		 188 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3863  30S ribosomal protein S9  59.26 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  49.69 
 
 		 159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4253  30S ribosomal protein S9  62.6 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 		 130 aa  138  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>