More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1126 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
172 aa  348  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  72.25 
 
 
173 aa  262  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  64.94 
 
 
169 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  65.45 
 
 
166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  64.57 
 
 
169 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4283  ribosomal protein S9  68.02 
 
 
171 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  64.53 
 
 
163 aa  211  4.9999999999999996e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  67.97 
 
 
162 aa  209  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0972  ribosomal protein S9  67.32 
 
 
173 aa  208  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0537605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  67.74 
 
 
168 aa  207  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  67.97 
 
 
162 aa  201  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  59.88 
 
 
170 aa  201  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  59.32 
 
 
171 aa  200  8e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  61.05 
 
 
162 aa  197  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0721  30S ribosomal protein S9  64.97 
 
 
167 aa  192  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  62.91 
 
 
162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2917  30S ribosomal protein S9  64.9 
 
 
168 aa  186  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954546  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  70.73 
 
 
174 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  68.75 
 
 
135 aa  183  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  66.41 
 
 
162 aa  179  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0662  ribosomal protein S9  60.61 
 
 
165 aa  175  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23240  SSU ribosomal protein S9P  59.06 
 
 
166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457375  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  56.67 
 
 
171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  57.05 
 
 
158 aa  170  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  57.05 
 
 
158 aa  170  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  57.05 
 
 
158 aa  170  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  64.75 
 
 
139 aa  167  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  60.74 
 
 
171 aa  166  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  66.39 
 
 
154 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0615  SSU ribosomal protein S9P  68.75 
 
 
135 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  0.442005 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1694  30S ribosomal protein S9  57.56 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.390598  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  52.41 
 
 
167 aa  160  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0253  ribosomal protein S9  60.13 
 
 
162 aa  157  6e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  54.14 
 
 
161 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13479  30S ribosomal protein S9  62.5 
 
 
151 aa  153  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0104915  hitchhiker  0.000207065 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  58.78 
 
 
130 aa  153  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6564  ribosomal protein S9  67.21 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0743813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  57.6 
 
 
130 aa  151  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  63.71 
 
 
130 aa  151  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  52.98 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  64.57 
 
 
130 aa  150  8.999999999999999e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  61.6 
 
 
130 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  60.98 
 
 
130 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  61.6 
 
 
130 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  58.73 
 
 
138 aa  147  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  52.05 
 
 
160 aa  147  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  52.05 
 
 
160 aa  147  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3863  30S ribosomal protein S9  63.7 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  59.06 
 
 
137 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  62.4 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  50.68 
 
 
160 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  62.4 
 
 
130 aa  144  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
158 aa  144  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1320  30S ribosomal protein S9  60 
 
 
137 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540344  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  50.69 
 
 
161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  48.17 
 
 
264 aa  143  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23301  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 
135 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  58.87 
 
 
131 aa  142  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16511  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 
137 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0633365  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 
130 aa  141  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  54.2 
 
 
130 aa  140  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  57.6 
 
 
131 aa  140  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  57.6 
 
 
131 aa  140  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  59.84 
 
 
131 aa  140  8e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1982  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 
133 aa  140  8e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0810268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4253  30S ribosomal protein S9  62.41 
 
 
154 aa  140  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  52.59 
 
 
162 aa  140  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 
130 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 
130 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 
130 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 
130 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 
130 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0349  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 
133 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 
130 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 
130 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2205  30S ribosomal protein S9  58.73 
 
 
135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 
135 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 
130 aa  138  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 
135 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  52.59 
 
 
161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2587  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 
138 aa  137  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2984  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 
136 aa  137  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  54.2 
 
 
130 aa  137  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 
130 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 
130 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  55.2 
 
 
132 aa  137  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  53.44 
 
 
130 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  51.11 
 
 
162 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  44.77 
 
 
162 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  49.65 
 
 
155 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  54.4 
 
 
130 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1624  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 
136 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.567552  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  52.34 
 
 
164 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  135  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  50.37 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>