More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0349 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0349  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 133 aa  271  3e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1982  30S ribosomal protein S9  96.99 
 
 		 133 aa  266  5e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0810268  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23301  30S ribosomal protein S9  90.91 
 
 		 135 aa  253  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16511  30S ribosomal protein S9  87.69 
 
 		 137 aa  241  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0633365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1102  30S ribosomal protein S9  85.61 
 
 		 135 aa  234  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19771  30S ribosomal protein S9  84.09 
 
 		 135 aa  230  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17131  30S ribosomal protein S9  83.08 
 
 		 136 aa  228  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453537  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1624  30S ribosomal protein S9  83.08 
 
 		 136 aa  227  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.567552  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17391  30S ribosomal protein S9  83.08 
 
 		 136 aa  227  5e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17231  30S ribosomal protein S9  81.54 
 
 		 136 aa  223  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2205  30S ribosomal protein S9  76.52 
 
 		 135 aa  212  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  69.7 
 
 		 137 aa  202  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  69.7 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  69.7 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  68.5 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1320  30S ribosomal protein S9  70.08 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540344  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2587  30S ribosomal protein S9  69.29 
 
 		 138 aa  192  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2984  30S ribosomal protein S9  67.72 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  62.02 
 
 		 131 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  62.02 
 
 		 131 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  56.39 
 
 		 132 aa  153  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  56.59 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  59.09 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 		 172 aa  140  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  59.09 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  58.33 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  58.33 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  58.33 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  58.33 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  56.25 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  58.33 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  58.33 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  58.33 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  137  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  57.58 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  57.58 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  52.63 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  57.58 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  53.85 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  53.12 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  48.51 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  49.62 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 		 130 aa  133  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 		 130 aa  133  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl492  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 		 173 aa  131  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  51.16 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  52.34 
 
 		 132 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 128 aa  130  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  50.75 
 
 		 133 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  53.97 
 
 		 170 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  56.82 
 
 		 131 aa  130  7.999999999999999e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  50.78 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  50.78 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  48.84 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  51.16 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  50.78 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  56 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 169 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 154 aa  126  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  53.54 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  49.21 
 
 		 132 aa  126  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  50 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  50 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  49.21 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  50.38 
 
 		 135 aa  124  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  51.54 
 
 		 168 aa  124  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  49.18 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 163 aa  124  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  53.03 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 166 aa  124  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2043  ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  49.21 
 
 		 264 aa  124  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3995  ribosomal protein S9  48.41 
 
 		 132 aa  124  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000512267 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  48.87 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  48.82 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  50.81 
 
 		 135 aa  123  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2424  SSU ribosomal protein S9P  55.81 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  49.21 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>