More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2613 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 169 aa  343  7e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  78.82 
 
 		 169 aa  276  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  65.9 
 
 		 173 aa  224  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  64.57 
 
 		 172 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  67.09 
 
 		 162 aa  208  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  66.05 
 
 		 162 aa  207  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  61.88 
 
 		 162 aa  202  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  62.35 
 
 		 170 aa  201  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4283  ribosomal protein S9  67.63 
 
 		 171 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0972  ribosomal protein S9  63.69 
 
 		 173 aa  198  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0537605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  58.9 
 
 		 166 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  63.16 
 
 		 163 aa  194  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  59.75 
 
 		 162 aa  190  7e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  60.65 
 
 		 168 aa  189  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  59.26 
 
 		 171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  71.09 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0721  30S ribosomal protein S9  62.28 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0662  ribosomal protein S9  65.38 
 
 		 165 aa  180  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  69.17 
 
 		 135 aa  178  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2917  30S ribosomal protein S9  69.92 
 
 		 168 aa  177  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954546  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  57.06 
 
 		 174 aa  175  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  54.82 
 
 		 167 aa  174  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23240  SSU ribosomal protein S9P  61.94 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  66.14 
 
 		 171 aa  168  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  65.35 
 
 		 171 aa  167  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  66.14 
 
 		 158 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  66.14 
 
 		 158 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  66.14 
 
 		 158 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  65.35 
 
 		 139 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  67.19 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0253  ribosomal protein S9  60 
 
 		 162 aa  160  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1694  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.390598  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  62.99 
 
 		 154 aa  157  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0615  SSU ribosomal protein S9P  70.73 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  0.442005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13479  30S ribosomal protein S9  69.29 
 
 		 151 aa  155  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0104915  hitchhiker  0.000207065 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  61.29 
 
 		 130 aa  153  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  63.71 
 
 		 130 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  61.29 
 
 		 130 aa  149  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  60.48 
 
 		 131 aa  147  8e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  51.85 
 
 		 264 aa  147  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6564  ribosomal protein S9  67.48 
 
 		 216 aa  146  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0743813  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  60.98 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  61.6 
 
 		 138 aa  144  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1320  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 137 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540344  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 128 aa  143  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  55.73 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  55.73 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  55.73 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3863  30S ribosomal protein S9  66.14 
 
 		 154 aa  141  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17131  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 136 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453537  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 132 aa  140  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1624  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 136 aa  140  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.567552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  56.8 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 128 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2205  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0905  ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.122737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  59.68 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4253  30S ribosomal protein S9  65.35 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2587  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17391  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 137 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  59.68 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  58.06 
 
 		 131 aa  139  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  46.01 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17231  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 136 aa  137  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  56.1 
 
 		 130 aa  137  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2984  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 136 aa  137  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  56.06 
 
 		 134 aa  136  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4944  ribosomal protein S9  56 
 
 		 132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3995  ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000512267 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 130 aa  135  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>