More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1249 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  80.16 
 
 		 130 aa  209  7e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  77.78 
 
 		 130 aa  204  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  73.81 
 
 		 130 aa  189  8e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  61.6 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  61.6 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  65.41 
 
 		 170 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  63.49 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  62.4 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  62.4 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  62.2 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  63.2 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  61.6 
 
 		 130 aa  146  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  62.12 
 
 		 162 aa  146  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf385  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0579956  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  62.88 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  61.36 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  60.8 
 
 		 130 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  64 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  64 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 132 aa  143  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  64 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  61.07 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  61.6 
 
 		 171 aa  141  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  61.6 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2205  30S ribosomal protein S9  58.52 
 
 		 135 aa  140  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 		 172 aa  140  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 		 134 aa  140  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 		 134 aa  140  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  55.3 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  54.55 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  59.06 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  61.6 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  58.33 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  58.33 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0727  30S ribosomal protein S9  65.6 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 		 137 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  56.06 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  53.03 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 174 aa  137  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  58.14 
 
 		 131 aa  136  7.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0972  ribosomal protein S9  59.84 
 
 		 173 aa  136  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0537605 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  53.79 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  57.6 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  60.32 
 
 		 135 aa  136  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  53.03 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0349  30S ribosomal protein S9  52.63 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  53.03 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0014  ribosomal protein S9  57.14 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1982  30S ribosomal protein S9  53.38 
 
 		 133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0810268  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  54.26 
 
 		 168 aa  134  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  60.48 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>