More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2120 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  100 
 
 		 130 aa  254  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  155  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  61.54 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 		 130 aa  153  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 		 130 aa  153  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 		 130 aa  153  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  153  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  61.6 
 
 		 264 aa  152  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  63.11 
 
 		 170 aa  152  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  63.49 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  63.71 
 
 		 172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  63.71 
 
 		 169 aa  150  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  60.94 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  62.9 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  56.92 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  59.06 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2043  ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  61.79 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  60.16 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  58.14 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  58.14 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  59.2 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  63.11 
 
 		 162 aa  146  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  62.9 
 
 		 169 aa  146  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  146  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  58.59 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  63.11 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  60.98 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3594  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000165532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  62.3 
 
 		 135 aa  143  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  59.02 
 
 		 174 aa  143  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  61.48 
 
 		 162 aa  143  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4221  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000135609  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 		 171 aa  142  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0748  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000172866  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17131  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453537  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>