More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1882 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  100 
 
 
264 aa  515  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  61.48 
 
 
130 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 
130 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 
130 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  56.8 
 
 
130 aa  152  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  61.6 
 
 
130 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 
130 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 
130 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  60.8 
 
 
130 aa  151  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  55.81 
 
 
130 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 
130 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  59.06 
 
 
130 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  58.73 
 
 
164 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 
130 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 
130 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  60.8 
 
 
130 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  56 
 
 
130 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  56 
 
 
130 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 
130 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 
130 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  56 
 
 
130 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  56 
 
 
130 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  56 
 
 
130 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 
130 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  56.8 
 
 
130 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  54.42 
 
 
170 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  52.15 
 
 
169 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  52.41 
 
 
166 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  56 
 
 
130 aa  149  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 
130 aa  149  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  53.01 
 
 
169 aa  148  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  55.73 
 
 
131 aa  148  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  148  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  55.73 
 
 
131 aa  148  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 
128 aa  148  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  55.2 
 
 
130 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 
130 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  57.48 
 
 
132 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
130 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 
130 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  54.4 
 
 
130 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  56 
 
 
130 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  54.4 
 
 
130 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 
160 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 
160 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 
161 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
161 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  53.15 
 
 
160 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  55.73 
 
 
131 aa  145  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
161 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  55.74 
 
 
130 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  59.35 
 
 
135 aa  145  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
173 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  57.72 
 
 
174 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 
130 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 
130 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  54.4 
 
 
130 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
161 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 
164 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  60.48 
 
 
162 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  52.8 
 
 
130 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  48.5 
 
 
172 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  54.26 
 
 
130 aa  143  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  59.54 
 
 
130 aa  143  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3594  30S ribosomal protein S9  54.4 
 
 
130 aa  142  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000165532  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
130 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 
130 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 
130 aa  142  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  62.1 
 
 
162 aa  142  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  142  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  59.68 
 
 
163 aa  142  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  142  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
155 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  57.94 
 
 
162 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>