More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3105 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  100 
 
 		 162 aa  326  9e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  78.66 
 
 		 162 aa  257  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  79.27 
 
 		 162 aa  255  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  76.97 
 
 		 163 aa  248  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0662  ribosomal protein S9  77.25 
 
 		 165 aa  233  7e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  72.67 
 
 		 162 aa  229  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  71.34 
 
 		 168 aa  224  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0972  ribosomal protein S9  73.83 
 
 		 173 aa  221  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0537605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  65.87 
 
 		 166 aa  220  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23240  SSU ribosomal protein S9P  70.48 
 
 		 166 aa  216  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457375  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  66.67 
 
 		 171 aa  216  8.999999999999998e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  65.68 
 
 		 170 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  67.97 
 
 		 172 aa  209  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  67.32 
 
 		 173 aa  207  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0721  30S ribosomal protein S9  72.61 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  61.88 
 
 		 169 aa  202  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2917  30S ribosomal protein S9  70.2 
 
 		 168 aa  201  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954546  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  58.82 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  75.2 
 
 		 135 aa  192  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  62.5 
 
 		 169 aa  191  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0253  ribosomal protein S9  66.46 
 
 		 162 aa  190  9e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1694  30S ribosomal protein S9  64.85 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.390598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4283  ribosomal protein S9  67.52 
 
 		 171 aa  184  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  70.4 
 
 		 162 aa  184  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  70.87 
 
 		 139 aa  184  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  61.54 
 
 		 167 aa  183  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  57.76 
 
 		 171 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  67.69 
 
 		 158 aa  176  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  67.69 
 
 		 158 aa  176  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  67.69 
 
 		 158 aa  176  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  66.15 
 
 		 171 aa  175  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  61.94 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0615  SSU ribosomal protein S9P  73.6 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  0.442005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  62.99 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13479  30S ribosomal protein S9  69.29 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0104915  hitchhiker  0.000207065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6564  ribosomal protein S9  67.46 
 
 		 216 aa  157  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0743813  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4253  30S ribosomal protein S9  70.08 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  63.11 
 
 		 130 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3863  30S ribosomal protein S9  68.5 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  58.87 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  59.02 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  60.66 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  61.48 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  61.48 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  61.48 
 
 		 130 aa  143  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 264 aa  143  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  58.33 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  57.69 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  54.26 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 130 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  51.75 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 131 aa  134  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 131 aa  134  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0430  ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.912667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  57.48 
 
 		 132 aa  133  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  54.92 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  54.1 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  46.88 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 		 130 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 130 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 130 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  56.56 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  45.68 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  47.59 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  45.68 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 135 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  54.1 
 
 		 130 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 135 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 130 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 130 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  46.99 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0676  30S ribosomal protein S9  54.4 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf385  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0579956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>