More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0972 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0972  ribosomal protein S9  100 
 
 
173 aa  348  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0537605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  67.65 
 
 
168 aa  229  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  68.05 
 
 
162 aa  224  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  69.88 
 
 
162 aa  223  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  69.51 
 
 
162 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  69.28 
 
 
162 aa  215  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  70.78 
 
 
163 aa  214  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  65.09 
 
 
166 aa  213  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  63.31 
 
 
172 aa  211  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2917  30S ribosomal protein S9  72.37 
 
 
168 aa  210  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954546  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0662  ribosomal protein S9  68.71 
 
 
165 aa  203  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  66.01 
 
 
169 aa  203  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  63.87 
 
 
173 aa  201  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  61.85 
 
 
171 aa  199  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0721  30S ribosomal protein S9  65.91 
 
 
167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  61.9 
 
 
169 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  60.36 
 
 
170 aa  190  7e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23240  SSU ribosomal protein S9P  61.85 
 
 
166 aa  182  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  72.13 
 
 
135 aa  180  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4283  ribosomal protein S9  60.95 
 
 
171 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  68 
 
 
174 aa  176  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  68 
 
 
139 aa  175  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  57.23 
 
 
162 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0253  ribosomal protein S9  63.4 
 
 
162 aa  174  7e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1694  30S ribosomal protein S9  63.4 
 
 
163 aa  173  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.390598  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  55.17 
 
 
171 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  65.6 
 
 
158 aa  167  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  65.6 
 
 
158 aa  167  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  65.6 
 
 
158 aa  167  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  54.34 
 
 
167 aa  164  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  64.8 
 
 
171 aa  164  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0615  SSU ribosomal protein S9P  71.31 
 
 
135 aa  162  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  0.442005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  61.6 
 
 
154 aa  157  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  58.11 
 
 
161 aa  157  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6564  ribosomal protein S9  61.7 
 
 
216 aa  152  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0743813  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13479  30S ribosomal protein S9  65.6 
 
 
151 aa  148  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0104915  hitchhiker  0.000207065 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  145  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 
130 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 
130 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  60.48 
 
 
130 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3863  30S ribosomal protein S9  64.8 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  138  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  56.45 
 
 
131 aa  138  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  56.15 
 
 
130 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 
130 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  57.38 
 
 
264 aa  137  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4253  30S ribosomal protein S9  63.2 
 
 
154 aa  137  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  59.84 
 
 
131 aa  136  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  60.63 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  58.06 
 
 
130 aa  133  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  54.1 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  132  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  56 
 
 
138 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 
130 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  52 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1320  30S ribosomal protein S9  51.47 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540344  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  128  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  51.54 
 
 
130 aa  128  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  53.97 
 
 
137 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 
130 aa  128  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2205  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 
135 aa  128  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  54.03 
 
 
131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 
131 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2587  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
138 aa  127  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  50.77 
 
 
130 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  50.77 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  50.77 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  52.67 
 
 
131 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  49.62 
 
 
158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  50.77 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  50.77 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf385  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 
132 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0579956  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
130 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17391  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
136 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  50.81 
 
 
132 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  52.42 
 
 
130 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  51.59 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  52.42 
 
 
130 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 
128 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0430  ribosomal protein S9  53.17 
 
 
130 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.912667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>