More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1694 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1694  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 163 aa  326  8e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.390598  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0253  ribosomal protein S9  93.25 
 
 		 162 aa  280  4.0000000000000003e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  66.26 
 
 		 163 aa  216  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  66.26 
 
 		 162 aa  211  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  64.42 
 
 		 162 aa  209  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  64.85 
 
 		 162 aa  207  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  62.05 
 
 		 166 aa  202  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  62.57 
 
 		 171 aa  199  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  60.71 
 
 		 162 aa  199  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0972  ribosomal protein S9  63.4 
 
 		 173 aa  193  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0537605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0662  ribosomal protein S9  64.85 
 
 		 165 aa  191  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  58.58 
 
 		 168 aa  191  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23240  SSU ribosomal protein S9P  62.65 
 
 		 166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  62.82 
 
 		 173 aa  185  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  57.56 
 
 		 172 aa  183  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2917  30S ribosomal protein S9  58.33 
 
 		 168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954546  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0721  30S ribosomal protein S9  62.28 
 
 		 167 aa  181  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 169 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  55.97 
 
 		 169 aa  179  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  64 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4283  ribosomal protein S9  60.47 
 
 		 171 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  62.6 
 
 		 135 aa  155  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  51.9 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  51.9 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  51.9 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  49.69 
 
 		 171 aa  150  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  64.8 
 
 		 130 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  59.84 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  49.37 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  61.9 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  62.1 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  62.4 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 139 aa  147  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  63.2 
 
 		 130 aa  147  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  62.4 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  60.48 
 
 		 131 aa  144  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  59.68 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  59.35 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  50 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  61.29 
 
 		 130 aa  141  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  60.8 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  61.6 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 130 aa  140  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 131 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 131 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  57.81 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf385  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0579956  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  58.87 
 
 		 131 aa  136  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0615  SSU ribosomal protein S9P  61.79 
 
 		 135 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  0.442005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  57.6 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2587  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 		 138 aa  134  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  56 
 
 		 132 aa  134  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  57.6 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  56 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0676  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 133 aa  132  3e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>