More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0676 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0676  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
133 aa  268  2e-71  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  62.99 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 
132 aa  155  2e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 
130 aa  150  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  59.06 
 
 
130 aa  149  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  61.42 
 
 
130 aa  149  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  59.06 
 
 
130 aa  148  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  59.06 
 
 
130 aa  148  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 
130 aa  147  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 
130 aa  147  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  55.91 
 
 
131 aa  144  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  55.91 
 
 
131 aa  144  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  53.54 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl492  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
131 aa  144  5e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  54.33 
 
 
130 aa  143  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  55.91 
 
 
130 aa  144  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 
131 aa  143  8.000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 
130 aa  143  9e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf385  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0579956  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  54.33 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 
130 aa  136  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 
130 aa  136  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 
130 aa  135  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  52.31 
 
 
131 aa  136  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 
130 aa  136  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 
130 aa  135  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  52.42 
 
 
135 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  56.35 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  56.91 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 
130 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0141  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 
130 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 
130 aa  133  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 
130 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  50 
 
 
162 aa  133  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 
130 aa  133  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 
130 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  51.15 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  53.54 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  51.16 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  53.17 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  131  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  51.64 
 
 
174 aa  131  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 
130 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  55.56 
 
 
130 aa  131  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0722  ribosomal protein S9  56.1 
 
 
130 aa  131  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4052  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 
130 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.809908  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  50.39 
 
 
131 aa  131  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  53.12 
 
 
132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 
154 aa  130  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 
128 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 
130 aa  129  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  54.4 
 
 
162 aa  129  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  54.76 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  52.38 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  53.54 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  56.35 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3451  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0078135 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  54.76 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  49.61 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 
130 aa  127  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 
130 aa  128  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  49.61 
 
 
129 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  51.18 
 
 
132 aa  128  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  53.97 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3156  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 
158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 
158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2639  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2876  ribosomal protein S9  52.38 
 
 
129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0513337  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 
158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  49.25 
 
 
166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>